Полное название белка: Транспортёр Глицеро-3-Фосфата
Сокращённое название белка: GlpT
Имя гена: glpt
Положение гена в геноме: b2240
Общая длина последовательности: 452 аминокислоты
Молекулярная масса белка: 50256 а.е.м.
Аминокислотный состав
Аминокислота | Количество | Частота в долях |
A | 45 | 0,09955 |
R | 17 | 0,03761 |
N | 13 | 0,02876 |
D | 14 | 0,03097 |
C | 7 | 0,01548 |
Q | 10 | 0,02212 |
E | 14 | 0,03097 |
G | 47 | 0,10398 |
H | 7 | 0,01548 |
I | 31 | 0,06858 |
L | 49 | 0,1084 |
K | 16 | 0,03539 |
M | 22 | 0,04867 |
F | 33 | 0,073 |
P | 24 | 0,05309 |
S | 20 | 0,04424 |
T | 15 | 0,03318 |
W | 15 | 0,03318 |
Y | 22 | 0,04867 |
V | 31 | 0,06858 |
Результат сравнения с аминокислотным составом разных групп белков Ecoli K-12
Альфа-спиральные белки | Бета-структурные белки | Трансмембранные белки | |
коэффициент корелляции | 0,5867 | 0,5434 | 0,89938 |
Выводы: |
1)Таким образом белок 1pw4 по своему составу ближе к альфа-спиральным белкам |
2)Белок GlpT наиболее вероятно является трансмембранным, ибо по составу наиболее близок к белкам класса TC.2A.(90%) |