Исследовался фрагмент для остатков 417-449
| |
| Фрагмент вторичной структуры с водородными связями(отмечено зелёным) | Ориентация С-бета атомов относительно симметрии структуры(С-бета-зелёные) |
Описание паттерна водородных связей:
Доминирующим патерном является: Н( i→i +4), где i-CO,(i +4)-NH. Также иногда,но редко встречается патерн H(i→i +3), например для LEU 449.N- LEU 446.O или для GLN 447.N-GLN 444.O. Также один раз мне встретился патерн H(i→i +5) для GLY 422.N – PHE 417.O
Описание расположения С-бета атомов относительно оси симметрии структуры:
С-бета атомы ориентированы таким образом, что находятся на периферии относительно оси семетрии структуры ( то есть окружают α-спираль, не проникая внутрь)