Работа с базой данных:
База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.
Согласно базе данных PFAM в белке GlpT существует 1 домен.
Изображение доменной структуры sugar_tr:
 |
Характеристика домена:
а) краткое название:sugar_tr;
б) расположение в последовательности: 29-446;
в) идентификатор записи в PFAM:PF00083;
г) краткое описание свойств домена:
Этот домен обнаружен в надсемействе АТФ-связывающих белков(ABC) и в главном надсемействе основных облегчителей диффузии(MFS).
ABC является мультикомпонентным надсемейством первичных активных переносчиков, способных транспортировать как микро, так и макромолекулы
в ответ на гидролиз АТФ, в то время как переносчики надсемейства MFS способны транспортировать малые растворённые молекулы в ответ на ионный осмотический градиент.
Изначально предполагалось, что переносчики MFS первично отвечали за транспорт сахаров,однако последние исследования показали, что они также принимают участие в переносе
метаболитов цикла Кребса, органофосфатов и др.
Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка.
 |
 |
Желтым цветом отмечен домен