Белок Mycobacterium senriense

Выбор белка

Фенилоксазолинсинтаза MbtB была найдена поиском по организму Mycobacterium senrience в UniProtKB ((organism_id:2775496)). У данной бактерии было найдено 7 белков, о которых было предоставлено небольшое количество информации. Можно сделать вывод, что данная бактерия еще мало изучена - вся информация о ее белках датирутеся не раньше 2022 года.

Информация о данном белке удовлетворяла условиям выбора, а также белок имел точное название. По этим причинам я выбрала Фенилоксазолинсинтазу MbtB

Функции : данный белок участвует в биосинтезе микобактина (является ферментом) и необходим для роста макрофагов, а также отвечает за биосинтез липидов.

Поисковые запросы

В первую очередь, я решила проверить, есть ли у других микобактерий этот белок : (taxonomy_id:1763) AND (protein_name:"Phenyloxazoline synthase MbtB"). На данной запрос было получено 292 результата. У других организмов (не микобактерий) обнаружилось 2257 таких белков : (protein_name:"Phenyloxazoline synthase MbtB") NOT (taxonomy_id:1763). Из этого можно сделать вывод, что фенилоксазолинсинтаза MbtB не является уникальным для микобактерий белком, но достаточно характерен для них

Затем я решила обратить внимание на функции фенилоксазолинсинтазы MbtB, а точнее на то, что она учатсвует в синтезе микобактина (taxonomy_id:1763) AND "mycobactin biosynthesis" - 1061 результат, (taxonomy_id:1763) AND "mycobactin biosynthesis" NOT (protein_name:"Phenyloxazoline synthase MbtB") - 781 результат. В результате было получено, что примерно четверть ферментов, участвующих в биосинтезе микобактина является Фенилоксазолинсинтаза MbtB.

Существование данного белка у Mycobacterium senriense было предсказано, и уровень аннотации крайне низок (1/5), поэтому я решила поискать его достоверное существование у микобактерий : (protein_name:"Phenyloxazoline synthase MbtB") AND (taxonomy_id:1763) AND (existence:1). В результате получила, что у Mycobacterium tuberculosis было найдено два таких белка ( с уровнем аннотации, соответственно, 4/5 и 5/5).