######################################## # Program: needle # Rundate: Thu Mar 23 2006 19:20:03 # Align_format: srspair # Report_file: ecoli_metja_2.needle ######################################## #======================================= # # Aligned_sequences: 2 # 1: SERA_ECOLI # 2: SERA_METJA # Matrix: EBLOSUM62 # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # # Length: 317 # Identity: 118/317 (37.2%) # Similarity: 184/317 (58.0%) # Gaps: 11/317 ( 3.5%) # Score: 510.0 # # #======================================= SERA_ECOLI 1 FLLVEGVHQKALESLRAAGYTNIEFHKGALDDEQLKESIRDAHFIGLRSR 50 .|:.:.:|:.|::.|...| .:|...| |..|:|.|.|:||..:.:||. SERA_METJA 1 ILVTDPLHEDAIKILEEVG--EVEVATG-LTKEELLEKIKDADVLVVRSG 47 SERA_ECOLI 51 THLTEDVINAAEKLVAIGCFCIGTNQVDLDAAAKRGIPVFNAPFSNTRSV 100 |.:|.|||..||||..||...:|.:.:|::||.::||.|.|||.:::.|| SERA_METJA 48 TKVTRDVIEKAEKLKVIGRAGVGVDNIDVEAATEKGIIVVNAPDASSISV 97 SERA_ECOLI 101 AELVIGELLLLLRGVPEANAKAHRGVWNKLAAGSFEARGKKLGIIGYGHI 150 |||.:|.:|...|.:|:|.|...||.|::......|..||.||:||.|.| SERA_METJA 98 AELTMGLMLAAARNIPQATASLKRGEWDRKRFKGIELYGKTLGVIGLGRI 147 SERA_ECOLI 151 GTQLGILAESLGMYVYFYD--IENKLPLGNATQ-VQHLSDLLNMSDVVSL 197 |.|:...|::.||.:..|| |..::......: |..:::|...:|.::| SERA_METJA 148 GQQVVKRAKAFGMNIIGYDPYIPKEVAESMGVELVDDINELCKRADFITL 197 SERA_ECOLI 198 HVPENPSTKNMMGAKEISLMKPGSLLINASRGTVVDIPALCDALASKHLA 247 |||..|.|::::|.::|:|||..::::|.:||.::|..||.:||....:. SERA_METJA 198 HVPLTPKTRHIIGREQIALMKKNAIIVNCARGGLIDEKALYEALKEGKIR 247 SERA_ECOLI 248 GAAIDVFPTEPATNSDPFTSPLCEFDNVLLTPHIGGSTQEAQENIGLEVA 297 .||:|||..|| |..:||...|||:.|||.|.||:|||:..|..|| SERA_METJA 248 AAALDVFEEEP-----PKDNPLLTLDNVIGTPHQGASTEEAQKAAGTIVA 292 SERA_ECOLI 298 GKLIKYSDNGSTLSAVN 314 .::.|........:.|| SERA_METJA 293 EQIKKVLRGELAENVVN 309 #--------------------------------------- #---------------------------------------