A- и В- формы ДНК. Структура РНК
Задание 1
Задание 2
Мое азотистое основание- тимин. В B-ДНК в большую бороздку обращены C4, C5, C6, C7, O4.
В малую бороздку- C2, O2. Оба азота находятся на границе между большой и малой бороздкой.
Тимин. Красным выделены атомы, обращенные в большую бороздку, синим в малую.
| Тип спирали | Шаг спирали (Å) | Число оснований на виток | Ширина большой бороздки | Ширина малой бороздки | |
|---|---|---|---|---|---|
| A-ДНК | Правая | 30.9 | 11 | 11 (A:C4-B:G5) | 15.1 (B:G5-A:G13) |
| В-ДНК | Правая | 36.7 | 10 | 17.3 (A:C3-B:T19) | 9.8 (B:T20-A:C9) |
| Z-ДНК | Левая | 43.5 | 12 | 7.2 (B:G73-A:G13) | 18.3 (A:C6-B:C72) |
Задание 3
Чтобы определить номера нуклеотидов, образующих стебли, ищем идущие по порядку спаренные нуклеотиды (все номера на 1 меньше, чем в файле, потому что почему-то нумерация нуклеотидов начинается с двух):
- (1-6) strand 1 - strand 2 (65-70)
- (48-52) strand 1 - strand 2 (61-65)
- (36-43) strand 1 - strand 2 (25-32)
- (9-11) strand 1 - strand 2 (22-24)
В структуре тРНК присутствуют неканонические связи (слева азотистое основание из strand 1, справа из strand 2). Заметьте, что если присутствующая здесь пара совпадает с Уотсон-Криковской, то это значит, что в ней от канонического варианта отличаются атомы, участвующие в образовании водородной связи:
- 53U-A57
- 54U-G17
- 36A-U32
- 37U-U31
- 43C-A25
- 12A-A44
- 13A-A20
- 14G-C47
В тРНК есть дополнительные водородные связи, стабилизирующие ее третичную структуру. Они образуются между следующими азотистыми основаниями (слева азотистое основание из strand 1, справа из strand 2):
- 53U-A57
- 54U-G17
- 12A-A44
- 13A-A20
- 14G-C47
- 18G-55C