Рис. 1 Бимак
Осьминог | |
| Характеристика | Значение/Описание |
|---|---|
| Название вида | Octopus bimaculoides Бимак |
| Краткое описание | Популярный домашний любимец. Непреметный окрас с двумя выделяющимеся пятнами. Часто путают с Octopus bimaculatus в силу того, что у них похожий окрас и перекрывающиеся ареалы обитания. |
| Число сборок геномов | 1 |
Информация о сборке | |
| Название | Octopus_bimaculoides_v2_0 |
| RefSeq AC | GCF_001194135.1 |
| Assembly level | Scaffold |
| Общая длина последовательности | 2,338,188,782 |
| Число скэффолдов | 151,674 |
| N50 скэффолдов | 475,182 |
| L50 скэффолдов | 1,333 |
| N50 контигов | 5,532 |
| L50 контигов | 97,860 |
| Число аннотированных белков | --- |
| Один из контигов | Получен по ссылке в пункте WGS GenBank файла. |
Рис. 1 Бимак
CDS прокариотических вирусов | |
| Характеристика | Значение/Описание |
|---|---|
GenBank | |
| Запрос | (("Rudiviridae"[Organism]) AND 20000:30000[SLEN])Rudiviridae |
| Количество находок | 8 |
Refseq | |
| Запрос | (("Rudiviridae"[Organism]) AND 20000:30000[SLEN])Rudiviridae AND srcdb_refseq[PROP] |
| Количество находок | 4 |
Для конкретного генома | |
| GenBank | NC_009965 |
| Латинское название | Acidianus rod-shaped virus 1 |
| Taxonomy ID | 309181 |
| тип генома | днк линейная, двухцепочечная(геномная gDNA) |
| хозяин вируса | Acidianus sp. Acii26 |
| fasta | файл получен путем нажимания на кнопки "Send to file" ->"Coding sequences" |
Ключи | ||
| Ключ | Значение/Описание | Применение |
|---|---|---|
| iDNA | Промежуточная ДНК. ДНК, которая устраняется любым из видов рекомбинации. | iDNA 312..404 /note="internal eliminated sequence" MH388468.1 |
| repeat_region | обозначает часто повторяющиеся регионы | repeat_region 134756..134991 /note="homology = 83.9%, counts = 118" /rpt_family="ta repeat" /rpt_type=TANDEM AJ010598.1 |
| misc_feature | Новый биологически значимый регион, который не может быть описан любым другим ключом | misc_feature 17052..17085 /note="match: EST AA714485" AJ010597.1 |
| assembly_gap | обозначает гэп в транскриптоме или геноме | assembly_gap 35860..36414 /estimated_length=555 /gap_type="within scaffold" /linkage_evidence="paired-ends" KQ415663.1 |
| D-loop | Петля смещения. Регион в митохондриальной ДНК, к одноцепочечной части котрого присоединяются короткие куски РНК, вытесняя таким образом ДНК, некогда бывшее на их месте. Также используется для описания других подобных "захватчиков" ДНК, катализируемых ферментом RecA. | D-loop 14818..15125 /note="A+T rich region containing origin of replication" MN756798.1 |
| mat_peptide | Координаты созревшего пептида, белка, или продукта посттрансляционных модификаций. НЕ ВКЛЮЧАЕТ СТОПКОДОНЫ. | mat_peptide complement(5628..5855) /gene="mp-MGF 110-2L" /locus_tag="F8224_gp010" /old_locus_tag="E75_009" /product="unnamed" /function="110 Multigene" /protein_id="YP_009704146.1" NC_044958.1 |
| N_region | Вставка нескольких нуклеотидов между перестроенными сегментами иммуноглобина | N_region 16..17 /note="n' at position 16 represents any repeating or combination of nucleotides running for a length of 120 residues" LP922795.1 |