Gene Ontology

Название файла: list18.txt
Количество ID в файле: 17
Все ID участвовали в анализе
Выдача содержит 99 GO terms, поскольку она содержит только результаты с FDR P < 0.05.
TOP 10 MOST significant results:
1)GO:0035383
2)GO:0006637
3)GO:0033865
4)GO:0033875
5)GO:0034032
6)GO:0006631
7)GO:0009150
8)GO:0009259
9)GO:0019693
10)GO:0006163
Иерархия в графе исключительно иерархическая: одно понятие включает в себя другое.
Данные GO terms регулируют метаболические процессы.

Для всех узлов существует 3D структура, но ID MEIKIN не нашелся.
Типы взаимодействий:
1)Известные взаимодействия: из курируемых баз данных и экспериментально показанные взаимодействия.
2)Предсказанные взаимодействия: соседние гены, слияние генов, совместное появление генов.
3)Другие: интелектуальный анализ текста, ко-экспрессия, гомология белков.
ID присутствуют во всех доменах рис. 3, что говорит об их консервативности, но есть таксоны, в которых они полностью отсутствуют: Thermotogales, Dictyoglomus, Caldisericum exile. Все они являются термофильными бактериями, возможно из-за сильной специфичности метаболизма у них ничего не нашлось.
У человека наблюдается всего 3 коэкспрессии генов, в то время как у всех остальных организмов эти 3 коэкспрессии сохраняются, при этом коэкспрессия ACOT4 и ACOT2 высококонсерватина.

Был выбран ID ACSM1
Описание:
Катализирует активацию жирных кислот CoA для получения acyl-CoA, это первый шаг в метаболизме жирных кислот. Способен активировать среднецепочечные жирные кислоты (от масляной до декановой) и некоторые карбоксилатсодержащие ксенобиотики, например бензоат. Также катализирует активацию липоата до липоил-нуклеозидмонофосфата.
Не удалось найти специфичность для локализации в мозгу.
Есть специфическая клеточная линия NTERA-2.
ID специфичен для женских тканей, где экспрессия РНК сильно превышает экспрессию белка.
РНК экспрессируется почти исключительно в клетках груди.