Описание альфа-глюкозидазы бактерии Pedobacter saltans DSM 12145

Последовательность альфа-глюкозидазы бактерии Pedobacter saltans DSM 12145 в формате FASTA:

   
    
               
   >gi|325106314|ref|NC_015177.1| alpha-glucosidase [Pedobacter saltans DSM 12145]
   MNKFKKLIQLFCLLFVALFYTSSHAQTANWTEIYPGVWKAIVGKPESYDLLKAAGAQPNK 
   DALSKTEKVSFPFANGGVSLEVSGGKTYLRFPLQKEEQLYGFGLNFQTVHQRGKILELHV
   DHYGGKDNGRTHAPTPFYVSSNGYGVFINSARYIKVWAGTGVRKDSENFPTPKDRNTDKT
   WSSRPYSDAVEILVPAEGVEVYVFGGPKPIDAVKRYNL

Альфа-глюкозидаза - фермент, отвечающий за расщепление сахарозы [1], распространенный как у эукариот, так и у прокариот. Относится к семейству 31 гликозил-гидролаз (GH31). Является схожим с человеческим ферментом альдоза 1-эпимераза [2].

Таблица 1. Описание альфа-глюкозидазы бактерии Pedobacter saltans DSM 12145

                                                                                                                                                                                                                                                                       
Параметр Значение
Идентификатор белка YP_004275968.1
Идентификатор GI 325106314
Идентификатор генома NC_015177.1
Координаты гена в геноме 4313091..4315250
Длина гена(в парах нуклеотидов) 2160
Цепь(прямая или обратная) прямая
Длина белка(в аминокислотных остатках) 719

Рисунок 1. Ген альфа-глюкозидазы Pedobacter saltans DSM 12145, обозначен как Pedsa_3617, и его геномное окружение [3].

Список источников

  1. https://en.wikipedia.org/wiki/Alpha-glucosidase
  2. ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_refseq/Bacteria/Pedobacter_saltans_DSM_12145_uid61349/NC_015177.gbk
  3. Pedobacter saltans DSM 12145, complete genome
© Котюргин Александр, 2015