1)Старт
2)Продолжение
Таблица 1. Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
| # | Имена атомов | Длина связи(Å) | Угол N-O-C(°) |
|---|---|---|---|
| Альфа-спирали | |||
| 1 | N(251ASN)-O(247GLU) | 2.92 | 151.9 |
| 2 | N(247GLU)-O(243ASP) | 3.12 | 153.4 |
| 3 | N(248LYS)-O(244LYS) | 3.07 | 148.5 |
| 4 | N(255GLU)-O(251ASN) | 2.79 | 160.4 |
| Бета-тяжи | |||
| 5 | N(710GLY)-O(648VAL) | 2.81 | 125.7 |
| 6 | N(650LEU)-O(711LYS) | 2.83 | 166.6 |
| 7 | N(713THR)-O(650LEU) | 3.02 | 163.9 |
| 8 | N(652ILE)-O(713THR) | 2.74 | 163.3 |
Обсуждение
По-видимому, длины большинства связей не выходят за пределы 2.7-3.1Å, а значения углов - за пределы 120-170°, причем только один угол выходит за пределы 140°-170°. Отклонение угла от ожидаемого значения 180°, при котором достигается максимальная энергия связей, возможно, связано с пространственными факторами. Эти данные согласуются с тем, что 90% водородных связей вида N-H-O имеют угол от 140° до 180° [1], а также c тем, что водородные связи преимущественно электростатической природы имеют длину 2.5-3.2Å [2].
Список источников