Укоренение в среднюю точку было сделано с помощью программы Figtree v1.4.3
Рис.1. Дерево белка EFTS таксона Firmicutes из задания 4 предыдущего практикума, получено алгоритмом "Neighbor Joining Using % Identity"
Укоренение произошло в ветвь, на которой находится таксон Lactobacillales, {LACDA, LACAC, STRP1}. Это дерево явно не соответствует реальной эволюционной истории, поскольку на две ветви оказался разделен таксон Bacilli, а часть этого таксона оказалась помещена на ветку с одноранговым таксоном Clostridia (ветка CLOTE). Также оказались разделены ветви таксона Bacillales ({BACSU, GEOKA} и {STAAR}), на разных ветвях оказались члены таксона Lactobacillaceae ({LACDA, LACAC}).