Для сравнения были выбраны структуры 2H35 (ЯМР, 20 моделей) и 1A3N (РСА, 1.8 Å) человеческого гемоглобина. Непосредственно в ядре найти водородные связи не удалось, поэтому были взяты остатки, удаленные от поверхности и привлекшие внимание "тройной" водородной связью.
Рис.1. Выравнивание РСА со всеми моделями ЯМР
Рис.2. Выравнивание РСА с одной моделью ЯМР
Рис.3. Остовная связь в альфа-спирали (#1)
Рис.4. Остовная связь в петле на поверхности (#2)
Рис.5. Связи боковых цепей (#3,4)
Таблица 1. Характеристики рассмотренных связей
| # | Связь | Длина в РСА-модели, Å | % моделей ЯМР со связью | Минимальная длина связи в ЯМР, Å | Максимальная длина связи в ЯМР, Å | Медианная длина связи в ЯМР, Å |
| 1 | A/ASP/64/O - A/ASN/68/N | 3.0 | 100 | 2.41 | 3.15 | 2.61 |
| 2 | B/PHE/42/O - B/PHE/45/N | 3.2 | 40 | 2.48. | 3.48 | 2.71 |
| 3 | C/ASN/97/ND2 - B/ASP/99/OD2 | 2.9 | 0 | - | - | - |
| 4 | C/ASN/97/ND2 - C/TYR/42/OH | 3.5 | 0 | - | - | - |
Можно заметить, что доля моделей, содержащих в себе связь #2, меньше 50%, что может объясняться подвижностью наружных петель. Связи #3,4 отсутствуют целиком, что может быть следствием разных условий получений модели (раствор/кристалл).