Белковый домен, на который упал мой выбор:
АС: PF00012
Summary name: Hsp70 protein
Белковых последовательностей в домене 27, структур - 446
| Таблица 11-3 | Информация | Комментарии |
|---|---|---|
| Выравнивание seed | Число последовательностей: 27 Число колонок: 691 |
|
| МДБ-all | участок 148-185 | MDB-all |
| 100% консервативные колонки в МДБ-all | 148:P; 156:R; 162:A; 167:G; 172:R; 175:N; 178:T; 179:A; 184:Y; 185:G | |
| МДБ-notall | Блок с 26 колонки по 71 колонку, 15 последовательностей | Я выбрал 43 колонку для того, чтобы сделать группу и отсортировать по наличию гэпа там, так как он находится на участке блока, который я выбрал для задания МДБ-notall |
| 100% консервативные колонки в МДБ-notall | 26:N; 29:G; 31:R; 33:T; 34:P; 35:S; 46:L; 48:G; 51:A; 52:K; 54:Q; 58:N; 62:T; 67:K; 68:R; 71:G | |
| Участок выравнивания, который не отражает эволюционного развития | участок с 618 до 671 | На данном участке много инделей, а в колонках много различий, этот участок практически не имеет совпадений ни абсолютных, ни даже функциональных. Выравнивание |