Банк MedLine - это поисковая система, созданная в National Center for
Biotechnology Information (NCBI).
PubMed разрабатывается в NCBI с целью создания интегрированного
доступа не только к MEDLINE,
но и к ресурсам, предоставляемым издателями журналов, цитируемых в MEDLINE.
В моем отчете представлена информация о работе в системе MEDLINE, некоторых ее
возможностях.
Я обнаружила 4 ссылки на статьи, в которых упоминается полное название
моего белка.
Результаты поиска сохранены в виде текста в файл
query1.txt
Я выбрала вторую статью - Cloning, sequencing, and
expression analysis of mouse glucosamine-6-phosphate deaminase
(GNPDA/oscillin)
Её аннотация ("Abstract") сохранена в текстовом формате в
файл abstract.txt
Последний автор статьи - Dube F. В результате поиска найдено 3 публикации этого автора
за последние 3 года.
Результаты поиска сохранены в виде текста в файле
query2.txt
Результат поиска (первые 20 результатов) об опоясывающем лишае (shingles)
сохранен в виде последовательных аннотаций (abstracts) в файл
query3.txt
PubMed распознает "разговорное" название "shingles" как "herpes zoster" или
опоясывающий герпес, опоясывающий лишай по-русски. Это в терминах MeSH Terms и
TIAB, а просто в тексте ищет слово shingles.
Дополнительные задания
Я нашла ссылки на публикации о кровотечении из носа (nosebleed)
при гипертонии (hypertension).Все полученные ссылки(133) я отобразила
на одной странице и сохранила в файл query_add1.txt
.
PubMed распознал термин "nosebleed" как nosebleed ("epistaxis"[TIAB]
NOT Medline[SB]) OR "epistaxis"[MeSH Terms] OR nosebleed[Text Word].
Т.е. чаще запросы распознаются как медицинские термины - epistaxis
(что не удивительно в
PubMed).
Я нашла ссылки на публикации о генетически модифицированной еде
(genetically modified food) и отобразила
результаты поиска в виде списка аннотаций. Первые 100 (из725) сохранила
в файл query_add2.txt.
Я решила найти информацию о болях зуба мудрости(wisdom tooth).
Согласно MeSH этот термин определяется как "molar, third"[MeSH Terms].
Я была поражена тем, во скольких статьях встречается этот термин. Получается,
что о зубах мудрости написано почти в 6 раз больше, чем о генетически
модифицированной еде!!! (4223 "зубных" результатов против 725 о ГМЕ)
Но это был запрос "зубы мудрости". После добавления слова pain(боль) результат
стал равен 728 ссылкам на статьи. Потом я попробовала
термин "зубная боль" (toothache) вместе с wisdom и получила всего 3 ссылки.
Это скорее всего говорит об ошибке, о том, что cочетания слов wisdom tooth pain,
toothache некорректны или о том, что система меня не правильно поняла или
о том, что намного больше пишут просто о зубах, чем о зубной боли!
Очень креативное задание про эксперименты с системой. Я бы предложила
поэкспериментировать с сервисом Limits и поискать
статьи на заданные темы (AIDS,Bioethics,Cancer), отдельно о животных и людях.
Причем людях разного возраста. Например, при запросе
Limits: AIDS, Adolescent: 13-18 years появляется множество статей о школьной
пропаганде против СПИДа.