ID pfam Globin
AC pfam PF00042
#SEED 73
#All 42k
#SW 1k
#architectures 318
#3D 1k
Taxonomy 23k
#eukaryota 23939
#archaea -
#bacteria 17866
Глобины представляют собой гемсодержащие белки, участвующие в связывании и/или транспортировке кислорода. Они принадлежат к очень большому и хорошо изученному семейству, широко распространенному во многих организмах. Глобины произошли от общего предка и могут быть разделены на три группы: однодоменные глобины и два типа химерных глобинов: флавогемоглобины и глобин-связанные сенсоры. У бактерий имеются все три типа глобинов, у архей отсутствуют флавогемоглобины, а у эукариот отсутствуют глобин-связанные сенсоры. У одного и того же вида могут сосуществовать несколько функционально различных гемоглобинов
Выравнивание seed Выравнивание
Максимальный достоверный блок, включающие ВСЕ последовательности Отсутсвует(проверено на % сходства=50)
100% консервативные колонки в МДБ-all 18:F; 88:H
"Максимальный достоверный блок, включающий НЕ ВСЕ последовательности. (МДБ-notAll) 12-18(кроме 69-73)
100% консервативные колонки в МДБ-notAll 12:Р
Участок выравнивания, в котором нет никаких достоверных подблоков, и потому маловероятно, что выравнивание на этом участке отражает ход эволюции. 62-68

выравнивание seed с точки зрения гомологичности всех последовательностей

Доменная архитектура 1 PF00042 - PF00175
Uniprot ID белка с архитектурой 1 HMP_XYLFA
Доменная архитектура 2 PF00042 - PF00970
Uniprot ID белка с архитектурой 2 Q6CB74_YARLI
Фото №2

У этих белков один совпадающий домен. Разрывы - это гэпы