Это свободноживущий круглый червь (нематода).Длина тела 1 мм. Полное развитие – 3-4 дня, срок жизни – 2-3 недели. Два пола (самцы ХО и гермафродиты ХХ) Первое многоклеточное, чей геном полностью секвенирован (уровень сборки - complete genome) На сегодняшний день прослежен путьразвития каждой клетки C.elegans, а такжеполностью описан коннектом – «карта»связей в нервной системе
Что каксается генома, то он состоит из 6 хромосом (5 аутосом + Х – хромосома)(в общем хромосом 12). Получены нокауты ряда генов
В поиск я ввела название организма и указала в фильтрах референсный геном, был найден 1 результат
Идентификатор GenBank | GCA_000002985.3 |
Идентификатор RefSeq (при наличии) | GCF_000002985.6 |
Общий размер генома (п.н.) | 100.3 Mb |
Число фрагментов генома в сборке | 6 |
Число скэффолдов | 6 |
Число контигов | 6 |
Scaffold N50 | 17.5 Mb |
Scaffold L50 | 3 |
Contig N50 | 17.5 Mb |
Contig L50 | 3 |
COntig N50: Длина контига, для которого половина (50%) всех нуклеотидов сборки содержится в контигах такой и большей длины
Contig L50: Число контигов (наименьшее), в которых содержится половина (50%) всех нуклеотидов сборкиЯ скачала информацию о своей сборке из RefSeq чере NCBI FTP
Scaffold то же самое
Нуклеотидные последовательности генома: GCF_000002985.6_WBcel235_genomic.fna.gz
Последовательности белков: GCF_000002985.6_WBcel235_protein.faa.gz
Последовательности генома с аннотацией: GCF_000002985.6_WBcel235_genomic.gbff.gz