Общая характеристика структуры UvrABC system protein B


Информация о белке
Полное название UvrABC system protein B
Сокращенное название Protein UvrB
Альтернативное название Excinuclease ABC subunit
Название на русском эксцизионная эндонуклеаза ABC, субъединица B
Количество аминокислот: 661 (621 в цепи A, 40 в цепи B)
Uniprot AC P37954
Uniprot ID UVRB_BACSU
PDB-code 2D7D






















Некоторые структурные картинки данного белка

Источник изображений

Аннотация

Система восстановления UvrABC отвечает за распознавание и обработку повреждений в цепочке ДНК. Две UvrA и две UvrB субъединицы составляют комплекс распознавания, который сперва сканирует ДНК для нахождения отклонений. После связывания комплекса UvrA2B2 к предполагаемому месту повреждения, ДНК оборачивается вокруг одного мономера UvrB. Оборот ДНК зависит от связывания UvrB с АТФ и, вероятно, является причиной локального ослабления участка спирали, облегчая вставку бета-шпильки UvrB между нитями ДНК. Затем UvrB проверяет одну из нитей на наличие повреждений. Если отклонение найдено, субъединицы UvrA отделяются, и комплекс UvrB-ДНК сформирован перед разрезом. Данный комплекс впоследствии свяжется с UvrC, тем самым освободив UvrB. Если же повреждений не будет найдено, ДНК обернется вокруг другой субъединицы UvrB, которая аналогичным образом исследует вторую цепь.
Локализация белка - цитоплазма клетки.
Кодирующий ген: uvrB (находится в локусе BSU35170 ДНК Bacillus subtilis)
Ссылка на информацию о белке на UniProt

Присутствуют 2 цепи, которые отдельно показаны на следующих рисунках с помощью JMOL:

Еще одно изображение всего белка (5491 атомов)Оставим только цепь A (5116 атомов)Только цепь B (313 атомов)

Коферментом белка является АДФ

Последовательность в формате FASTA

>sp|P37954|UVRB_BACSU UvrABC system protein B OS=Bacillus subtilis (strain 168) GN=uvrB PE=1 SV=2

MKDRFELVSKYQPQGDQPKAIEKLVKGIQEGKKHQTLLGATGTGKTFTVSNLIKEVNKPTLVIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPNN AVEYFVSYYDYYQPEAYVPQTDTFIEKDASINDEIDKLRHSATSALFERRDVIIIASVSCIYGLGSPEEYREMVVSLRTEMEIERN ELLRKLVDIQYARNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASRDEHCVRVEFFGDEIERIREVDALTGEILGDRDHVAIFPASHFVTRAEK MEKAIQNIEKELEEQLKVMHENGKLLEAQRLEQRTRYDLEMMREMGFCSGIENYSRHLTLRPPGSTPYTLLDYFPDDFMIVVD ESHVTIPQVRGMFNGDQARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLRFEEFEKHMHNIVYVSATPGPYEIEHTDEMVEQIIRPTGLLDPLID VRPIEGQIDDLIGEIQARIERNERVLVTTLTKKMSEDLTDYLKEIGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRLGKYDVLVGINLLREGLDI PEVSLVAILDADKEGFLRSERSLIQTIGRAARNAEGRVIMYADKITKSMEIAINETKRRREQQERFNEEHGITPKTINKEIRDVIRA TVAAEDKAEYKTKAAPKLSKMTKKERQKVVEQMEHEMKEAAKALDFERAAELRDLLLELKAEG
Информация взята с базы данных UniProt