Частичное множественное выравнивание: MEME и MAST

• Главная
• Семестры
• Проекты
• Обо мне
• Ссылки

Множественное выравнивание мотивов (JAR-FILE)

Мотив 1 (RESIII домен)



Мотив 2 (C-концевой домен)



Мотив 3 (АТФ-связывающий домен)



ВЫВОД:Локальное множественное выравнивание найденных мотивов, построенное MEME, идентично глобальному множественному выравниванию, построенным в программе T-Coffee.

MAST

Файл SEED_ResIII.fasta содержит 55 FASTA-последовательностей белков. У этих 55 белков был проведён поиск мотивов, найденных MEME у репрезентативной выборки гомологов UVRB_BACSU, на основании построенной MEME для каждого мотива позиционно-специфической матрицы.
Выравнивание ResIII домена 55 белков в формате MSF.

• mastout.html

© Mamedov Adalyat