В результате применения скрипта evolve_protein.pl были получены следующие мутанты белка UVRB_BACSU:
Полученные мутанты были выровнены с исходным белком. Рис. 1-3 показывают выравнивание, в определенных позициях.
Мутант 1 | Мутант 2 | Мутант 3 |
Остатки с 329 по 348. | Остатки с 366 по 385. | Остатки с 376 по 395. |
Фрагмент последовательности белка - сверху, мутированный фрагмент - снизу |
Мутант | Идентичность | Сходство | Вес по BLOSUM62 |
1 | 25% | 40% | 13 |
2 | 35% | 45% | 11 |
3 | 70% | 70% | 60 |
Для составления выравнивания последовательности белка UVRB_BACSU с последовательностями двух его ортологов был составлен fasta файл со всеми тремя последовательностями. Для выравнивания использовалась функция Web services => Alignment => Muscle with default. Получилось тройное выравнивание. Далее были составлены fasta файлы, содержащие выровненные последовательности белков попарно.
Тройное выравнивание, с окраской ClustalX. Окрашены те участки, где совпадают хотя бы две аминокислоты разных последовательностей |
Аминокислотные остатки с 365 по 384 |