| Поиск гомологов UVRB_BACSU с помощью protein blast | ||||||
| Поиск | Алгоритм BLAST | Название базы данных | Ограничения по таксонам | Порог e-value | Запрашиваемое количество хитов | Количество найденных хитов |
| Прокариоты | protein blast (blastp) | RefSeq | Procaryota, без Firmicutes | 1e-10 | 500 | 500 |
| Эукариоты | Eukaryota | 0.001 | 500 | 214 | ||
| Репрезентативная выборка гомологов UVRB_BACSU (20) | |||
| Домен | Тип | Вид | Количество гомологов |
| Archaea | Euryarchaeota | Methanobacterium formicicum Methanobrevibacter smithii Methanolobus psychrophilus | 3 |
| Bacteria | Acidobacteria | Granulicella tundricola | 1 |
| Actinobacteria | Arthrobacter gangotriensis Collinsella intestinalis Saccharomonospora viridis Slackia piriformis Streptomyces bottropensis Streptomyces somaliensis | 6 | |
| Chlamydiae | Parachlamydia acanthamoebae | 1 | |
| Cyanobacteria | Arthrospira maxima Chroococcidiopsis thermalis Microcystis aeruginosa Nostoc punctiforme Synechococcus elongatus | 5 | |
| Eucaryota | Arthropoda | Drosophila melanogaster | 1 |
| Ascomycota | Saccharomyces cerevisiae | 1 | |
| Chordata | Human | 1 | |
| Mycetozoa | Dictyostelium discoideum | 1 | |
| Таксономические деревья родства гомологов UVRB_BACSU | ||
| Bacteria | Eukaryota | В скобках указано количество гомологов в каждом таксоне |
| | |
На рисунке гидрофобные-ароматические остатки выеделены оттенками красного цвета, гидрофобные ароматические - желтым, гидрофильные заряженные (-) оттенками серого, гидрофильные заряженные (+) отмечены зеленым, гидрофильные незаряженные - красным.
Гомологи белка имеют с ним схожие структуры, что можно увидеть исходя из выравнивания.
На рисунке изображена цепь А белка UVB_BACSU, остатки белка раскрашены в соответсвии
с цветовой палитрой Сlustalx. АДФ выдлен командой cpk и покрашен в фиолетовый цвет.
