Геномные браузеры

UCSC

В геномной браузере найдем ген моего белка. Некоторая информация о нем:


Fig.1 Гены USCS и RefSeq (USCS Genes и RefSeq Genes)

Fig.2 Метилирование ДНК (ENC_DNA_Methylation)

Fig.3 Консервативность последовательности среди млекопитающих (Conservation)

Fig.4 Полиморфизмы (Common SNPs)

ENSMBL

С помощью ENSMBL было построено Clustal-выравнивание выбранного гена (MTPN, Myotrophin) человека с гомологичным геном шимпанзе. Затем к полученному файлу с выравниваем была применена команда distmat align.txt. Из полученного файла видно, что показатель равен 0,78, и свидетельствует он о крайней близости последовательностей (в среднем 0.78 несовпадений на 100 пар оснований).

Также с помозью ENSML была получена таблица полиморфизмов гена MTPN: