Что такое филогенетическое дерево


Из данного списка бактерий отдела Firmicutes были выбраны следующие 7 (четные):

НазваниеМнемоника
Bacillus subtilisBACSU
Clostridium tetaniCLOTE
Finegoldia magnaFINM2
Lactobacillus acidophilusLACAC
Lactococcus lactisLACLM
Staphylococcus aureusSTAA1
Streptococcus pyogenesSTRP1









На приведённом филогенетическом дереве отметим выбранные нами организмы:



Теперь составим скобочную формулу искомого дерева:
((CLOTE, FINM2),(((LACLM,STRP1),LACAC),(BACSU,STAA1)))

С помощью программы Mega, было получено дерево выбранных организмов:



Теперь приведем описание нетривиальных ветвей этого дерева:

(CLOTE, FINM2) vs (LACLM, STRP1, LACAC, BACSU, STAA1)
(LACLM, STRP1) vs (CLOTE, FINM2, LACAC, BACSU, STAA1)
(LACLM, STRP1, LACAC) vs (CLOTE, FINM2, BACSU, STAA1)
(BACSU, STAA1) vs (CLOTE, FINM2, LACLM, STRP1, LACAC)