Из данного списка бактерий отдела Firmicutes были выбраны следующие 7 (четные):
Название | Мнемоника |
Bacillus subtilis | BACSU |
Clostridium tetani | CLOTE |
Finegoldia magna | FINM2 |
Lactobacillus acidophilus | LACAC |
Lactococcus lactis | LACLM |
Staphylococcus aureus | STAA1 |
Streptococcus pyogenes | STRP1 |
На приведённом филогенетическом дереве отметим выбранные нами организмы:
Теперь составим скобочную формулу искомого дерева:
((CLOTE, FINM2),(((LACLM,STRP1),LACAC),(BACSU,STAA1)))
С помощью программы Mega, было получено дерево выбранных организмов:
Теперь приведем описание нетривиальных ветвей этого дерева:
(CLOTE, FINM2) vs (LACLM, STRP1, LACAC, BACSU, STAA1)
(LACLM, STRP1) vs (CLOTE, FINM2, LACAC, BACSU, STAA1)
(LACLM, STRP1, LACAC) vs (CLOTE, FINM2, BACSU, STAA1)
(BACSU, STAA1) vs (CLOTE, FINM2, LACLM, STRP1, LACAC)