Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)


Определение, в каких метаболических путях участвует фермент Q9NZJ5

Согласно SwissProt идентификатор данного фермента Киотской энциклопедии генов и геномов: (KEGG) hsa:9451. На сайте KEGG откроем страничку с соответствующим hsa и определим метаболические пути белка. Ниже приведена соответствующая таблица:
KEGG ID EN RU
hsa04141 Protein processing in endoplasmic reticulum Процессинг белка в эндоплазматическом ретикулуме
hsa04932 Non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) Безалкогольная жировая дистрофия печени (NAFLD)
hsa05010 Alzheimer's disease Болезнь Альцгеймера
hsa05160 Hepatitis C Гепатит C
hsa05162 Measles Корь
hsa05164 Influenza A Грипп А
hsa05168 Herpes simplex infection Простой герпес
hsa05169 Epstein-Barr virus infection Вирусная инфекция Эпштейна-Барра












Карта первого из найденных путей:



Структурные формулы заданных соединений в KEGG

32й номер => L-лизин и ацетил-СоА. Таблица:

RU EN Идентификатор Структурная формула
L-лизин L-lysine C00047
Ацетил-СоА Acetyl-CoA C00024










Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому

При помощи сервиса KEGG PATHWAY были найдены метаболического пути между L-лизином и Ацетилом-CoA:

Карта: Биосинтез лизина
Пусть: Ацетил-coA ==> L-лизин

Ниже схема метаболического пути перехода от Ацетила-coA (зеленый) к L-лизину (красный) через интермедиаты (желтый).