№ | Pfam AC | Pfam ID | Полное название семейства доменов | Положение в последовательности белка OXDC_BACSU | Клан |
1 | PF00190 | Cupin_1 | "Семейство доменов названо от cupa - (лат.) термин, обозначающий маленькие баррель. Это семейство представляет сохраненные cupin-баррели, содержит 11S и 7S белки ядерного хранения в растении, является основным источником азота для реакций" | 50-192 | Клан Cupin (CL0029) содержит 35 семейств. С неизвестной функцией - 12 семейств: cupin_2, cupin_3, cupin_4, Cupin_5, DUF1255, DUF386, DUF1637,DUF1479, DUF1498, DUF1637, DUF1971, CsiD(предполагаемая ф-я) |
2 | PF00190 | Cupin_1 | -||-||-||- | 228-366 | -||-||-||- |
Таксон
|
Количество белков с доменом PF00190
|
|
Эукариоты | Зеленые растения | 1250 |
Грибы | 79 | |
Животные | 1 (Trichomonas vaginalis G3) | |
Остальные эукариоты | 2 (Mycetozoa, один вид слизевиков) | |
Бактерии | 268 | |
Археи | 8 |
№ | PFAM ID | Bacillus subtilis |
1. | Cupin_1 | OXDC_BACSU |
2. | Cupin_1 | OXDD_BACSU |
5.Экспортированный файл в формате msf | seed.msf