MEME

1. Всего найдено три мотива.

   № Мотив	Длина мотива	Относительная энтропия	Наличие в последовательностях	Координаты в OXDC_BACSU	P-value в OXDC_BACSU
   Мотив 1	44	135.1	Во всех	257-300	6.72e-40
   Мотив 2	41	122.3	Во всех	100-140	4.1e-35
   Мотив 3	41	144.1	В пяти из восьми	в OXDC_BACSU не представлен

2. Ссылка на файл формата msf с отмеченными (раскраска 4мя оттенками)мотивами; первый - красный цвет, второй - синий цвет, третий - оранжевый цвет.
3. Согласно тому, что мы получили из MAST в 193 последовательностях из 225 нашелся хотя бы один из трех заданных мотивов. Но ни в одном из них нет одновременно трех мотивов, описанных MEME. Таким образом, для всех семи последовательностей были найдены мотивы 1 и 2 (к удивлению в наглядной таблице они были в различных ячейках), но для пяти последовательностей, в которых MEME опознал 3ий мотив, его не было. Выравнивания полностью соответствовали выбранным мотивам.
   ссылка на страницу MASTout

   ---

   ©Джумашев