на главную страницу

Поисковые системы

1.Все три поисковые системы содержат в целом одинаковую информацию, но наиболее удобно рассматривать в том виде, который предложен в системе SRS. Кроме того там довольно наглядно показана вторичная структура белка, лиганды, и т.п.

2. Taxonomy

№ Pfam AC Pfam ID Полное название семейства доменов Положение в последовательности белка OXDC_BACSU Клан

gammacoronavirus 70

gammaherpesvirinae 284

gammalipothrixvirus 40

gammapapillomavirus 30

gammaproteobacteria 120605

gammaretrovirus 126

gammaridea 1

Гаммапротеобактерии - gammaproteobacteria(англ.яз.), кол-во страниц 120605

3.Сравнение функций

Запросы

Формулировка функции белка	Строка запроса	Количество найденных документов
convert	*([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria] & ([swissprot-Comment:convert] > parent ))*	2020
catalyze oxidation	*([swissprot-Taxonomy:gammaproteobacteria] & ((([swissprot-Comment:catalyze] & [swissprot-Comment:oxidation]) \| [swissprot-Comment:catalyze oxidation]) > parent ))*	1521
К сожалению большинство запросов	таких как convert oxalate, convert to produce, catalyze oxalate oxidation и др.	оказались безрезультатными

4.Сохранение найденного материала в формате fasta.

файл с результатом запроса catalyze oxidention

5.(дополнение задание)

Строка запроса: ([medline-AllText:OXDC*] & [medline-Year#2008:2010])
Количество страниц: 10

6.(дополнительное задание)

Среди опубликованных в 70е годы статей было найдено 27 статей, в которых принимал участие Нейфах А.А.
Запрос: ([medline-Authors:Nefa,A.A.*] & [medline-Year#1970:!1980])
Результат опроса давал три различных варианта написания фамилии Neyfakh,NeÎfakh,Neifakh. Но после просмотра было понятно, что это один и тот же человек. Главный интерес (в 70е годы): исследования по сравнению наследования генетической информации, процессов синтеза белка и митоза в гибридных организмах разных рыб.

©Джумашев