ID SEQUENCE_PROFILE; MATRIX. AC ZZ99999; DT Fri May 20 16:17:06 2011 DE Generated from MSF file: 'rs6_al.msf'. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=129; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0000000; R2=0.0100000; TEXT='No_units'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=850; N_SCORE=8.5000000; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=650; N_SCORE=6.5000000; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='M'; M=-10,-30,-10,-30,-20,0,-30,-20,10,-10,20,50,-20,-20,0,-10,-10,-10,10,-10,-10,-10; MA /M: SY='M'; M=-6,-29,-9,-29,-19,-2,-28,-20,8,-10,18,45,-20,-19,-1,-10,-8,-9,9,-12,-11,-10; MA /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-20,0,-30,-20,0,-30,20,-20,-10,0,-20,10,50,-10,-10,-30,-30,-20,0; MA /M: SY='H'; M=-13,-2,-27,-10,2,-18,-20,33,-27,10,-23,-15,5,-15,2,5,-3,-5,-22,-23,0,2; MA /M: SY='Y'; M=-20,-30,-20,-30,-20,30,-30,20,-10,-20,-10,-10,-20,-30,-10,-20,-20,-20,-10,20,70,-20; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-40,20,50,-30,-20,0,-30,10,-30,-20,0,-10,20,0,0,-10,-20,-30,-20,40; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-10,-30,-28,-2,-38,-30,38,-28,18,10,-30,-28,-28,-30,-20,-8,32,-30,-10,-28; MA /M: SY='M'; M=-6,-30,-10,-30,-21,-4,-31,-25,21,-16,16,30,-25,-21,-11,-20,-15,-6,24,-20,-10,-16; MA /M: SY='Y'; M=-15,-35,-15,-35,-25,15,-35,-5,5,-20,15,5,-25,-30,-15,-20,-20,-15,0,0,30,-25; MA /M: SY='I'; M=-10,-35,-10,-35,-30,0,-40,-30,30,-25,30,15,-30,-30,-25,-25,-20,-10,20,-25,-10,-30; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-10,-30,-24,-6,-34,-30,34,-24,14,10,-30,-24,-24,-30,-20,-4,36,-30,-10,-24; MA /M: SY='H'; M=-15,-5,-30,-15,0,-20,-20,40,-30,5,-25,-15,5,-20,5,25,-10,-15,-30,-25,0,0; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-30,-20,-20,70,-10,-20,-10,-10,-20,-40,-30,-10; MA /M: SY='D'; M=-18,32,-30,33,8,-30,0,-3,-31,-7,-36,-26,30,-15,-2,-12,4,-7,-30,-38,-26,3; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='Q'; M=-12,10,-33,17,30,-30,-18,-2,-30,7,-27,-12,2,-10,32,2,0,-10,-22,-27,-17,30; MA /M: SY='E'; M=-1,8,-24,13,23,-25,-9,-6,-25,3,-26,-16,6,-10,8,-7,20,0,-21,-31,-21,18; MA /M: SY='D'; M=-17,30,-33,47,30,-30,-13,-7,-30,-3,-37,-27,7,-10,7,-13,0,-10,-27,-37,-27,20; MA /M: SY='Q'; M=8,-6,-19,-5,11,-26,-12,-8,-23,3,-18,-6,-6,-10,23,1,7,-5,-13,-25,-15,15; MA /M: SY='K'; M=-5,-16,-20,-20,-5,-20,-25,-18,0,9,-5,1,-15,-16,-2,-3,-11,-5,9,-29,-14,-4; MA /M: SY='K'; M=-6,-14,-22,-18,-3,-23,-24,-18,-5,13,-8,-2,-14,-8,-1,-5,-9,-6,5,-30,-16,-3; MA /M: SY='G'; M=23,-16,-13,-16,-14,-24,25,-20,-23,-14,-23,-18,-12,-14,-14,-14,6,-8,-13,-26,-24,-14; MA /M: SY='M'; M=-8,-33,-10,-33,-23,-2,-33,-25,17,-15,25,33,-25,-23,-10,-17,-15,-8,15,-17,-10,-18; MA /M: SY='V'; M=-2,-31,-10,-31,-22,-8,-32,-30,30,-21,13,11,-30,-22,-21,-29,-20,-2,37,-29,-10,-22; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-40,20,50,-30,-20,0,-30,10,-30,-20,0,-10,20,0,0,-10,-20,-30,-20,40; MA /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-20,0,-30,-20,0,-30,20,-20,-10,0,-20,10,50,-10,-10,-30,-30,-20,0; MA /M: SY='Y'; M=-20,-30,-20,-30,-25,45,-30,5,-5,-25,-5,-5,-25,-35,-20,-25,-20,-20,-10,15,50,-25; MA /M: SY='N'; M=-10,-1,-19,-7,-11,-17,-19,-13,1,-10,-8,-7,7,-22,-13,-13,-4,-6,-2,-34,-17,-12; MA /M: SY='G'; M=1,1,-22,-3,-8,-26,25,-11,-30,-8,-30,-20,14,-16,-8,-13,18,-4,-26,-28,-24,-8; MA /M: SY='V'; M=-8,-18,-18,-18,-6,-15,-28,-17,6,-9,1,9,-17,-18,8,-12,-11,-8,10,-24,-10,-1; MA /M: SY='I'; M=-10,-35,-10,-35,-30,0,-40,-30,30,-25,30,15,-30,-30,-25,-25,-20,-10,20,-25,-10,-30; MA /M: SY='K'; M=2,-7,-18,-12,0,-25,-17,-15,-20,20,-15,-10,-3,-10,0,5,5,12,-10,-27,-20,0; MA /M: SY='E'; M=-3,6,-28,10,28,-27,-13,-4,-25,4,-25,-17,5,-11,10,-3,9,0,-18,-30,-20,22; MA /M: SY='N'; M=8,3,-19,-3,3,-26,2,-7,-23,-4,-23,-17,12,-14,-3,-6,8,-3,-16,-33,-21,1; MA /M: SY='G'; M=-8,11,-30,19,-3,-30,31,-16,-36,-16,-40,-30,4,-16,-12,-20,0,-16,-30,-28,-30,-8; MA /M: SY='G'; M=18,-13,-16,-13,-14,-25,30,-19,-26,-14,-26,-20,-8,-15,-14,-15,8,-9,-17,-25,-25,-14; MA /M: SY='E'; M=-10,5,-35,9,34,-30,-20,-1,-30,13,-25,-11,0,-10,32,6,0,-10,-20,-26,-16,33; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-10,-30,-28,-2,-38,-30,38,-28,18,10,-30,-28,-28,-30,-20,-8,32,-30,-10,-28; MA /M: SY='H'; M=-13,-13,-20,-18,-12,-8,-27,27,-7,-15,-7,-7,-5,-22,-10,-10,-10,-5,-8,-22,3,-12; MA /M: SY='R'; M=-11,2,-33,-4,11,-30,-10,0,-31,11,-26,-16,10,-18,8,23,-3,-9,-28,-31,-21,8; MA /M: SY='L'; M=-1,-24,-12,-23,-14,-11,-27,-23,7,-13,12,5,-18,-20,-13,-17,-6,4,8,-24,-14,-15; MA /M: SY='E'; M=-9,4,-33,5,28,-29,-20,-6,-28,25,-24,-15,0,-10,13,8,1,-5,-18,-29,-20,23; MA /M: SY='D'; M=-18,35,-32,53,25,-30,-12,-8,-30,-7,-38,-28,8,-10,3,-17,0,-10,-28,-38,-28,15; MA /M: SY='W'; M=-30,-40,-20,-40,-30,10,-20,-20,-30,-30,-20,-10,-40,-40,-20,-30,-30,-20,-30,110,20,-30; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,60,-20,-40,-20,-40,-30,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-15,5,-30,-20,-5,-30,35,-20,-10,0,-15,10,35,-5,-10,-25,-30,-20,5; MA /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-20,0,-30,-20,0,-30,20,-20,-10,0,-20,10,50,-10,-10,-30,-30,-20,0; MA /M: SY='Q'; M=-10,-5,-30,-10,10,-30,-20,0,-30,15,-20,-5,0,-15,30,30,-5,-10,-25,-25,-15,15; MA /M: SY='L'; M=-10,-40,-10,-40,-30,0,-40,-30,20,-20,40,20,-30,-30,-20,-20,-20,-10,10,-20,-10,-30; MA /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10; MA /M: SY='Y'; M=-20,-30,-20,-30,-20,30,-30,20,-10,-20,-10,-10,-20,-30,-10,-20,-20,-20,-10,20,70,-20; MA /M: SY='P'; M=-10,-6,-33,3,19,-32,-21,-10,-27,0,-26,-14,-10,23,6,-9,-5,-10,-18,-33,-23,15; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-10,-30,-30,0,-40,-30,40,-30,20,10,-30,-30,-30,-30,-20,-10,30,-30,-10,-30; MA /M: SY='N'; M=-19,28,-30,9,2,-30,-2,9,-30,1,-29,-18,55,-19,4,1,9,-1,-29,-38,-19,3; MA /M: SY='K'; M=-14,17,-30,19,14,-30,-16,-10,-30,25,-28,-18,4,-10,6,3,0,-10,-24,-34,-24,10; MA /M: SY='F'; M=-14,-32,-14,-32,-28,20,-36,-17,18,-27,13,6,-28,-33,-25,-27,-20,-14,10,-10,13,-28; MA /M: SY='H'; M=-10,-5,-28,-14,1,-21,-18,30,-28,10,-23,-14,3,-18,4,19,-7,-13,-26,-26,-3,1; MA /M: SY='K'; M=-13,15,-32,18,20,-30,-17,-8,-30,23,-28,-18,3,-10,8,3,0,-10,-23,-33,-23,15; MA /M: SY='G'; M=20,-15,-15,-15,-15,-25,30,-20,-25,-15,-25,-20,-10,-15,-15,-15,5,-10,-15,-25,-25,-15; MA /M: SY='H'; M=-20,-15,-25,-20,-14,23,-25,38,-16,-19,-16,-11,-9,-29,-13,-14,-15,-20,-20,-4,28,-14; MA /M: SY='Y'; M=-20,-30,-20,-30,-20,30,-30,20,-10,-20,-10,-10,-20,-30,-10,-20,-20,-20,-10,20,70,-20; MA /M: SY='I'; M=-13,-16,-17,-20,-17,-8,-28,-10,10,-16,6,9,-8,-24,-10,-15,-11,-9,6,-26,-9,-14; MA /M: SY='I'; M=-9,-34,-2,-34,-31,-2,-39,-30,28,-26,26,13,-30,-30,-26,-26,-19,-10,18,-25,-11,-30; MA /M: SY='M'; M=-5,-31,-10,-31,-21,-5,-31,-26,21,-16,17,28,-26,-21,-12,-21,-16,-5,25,-21,-10,-17; MA /M: SY='N'; M=-18,21,-30,3,1,-30,-5,7,-30,8,-28,-18,45,-19,3,10,6,-3,-29,-38,-20,1; MA /M: SY='V'; M=-3,-31,-10,-31,-23,-8,-33,-30,31,-22,14,11,-30,-23,-22,-29,-20,-3,36,-29,-10,-23; MA /M: SY='E'; M=-11,8,-33,8,27,-28,-18,-3,-25,13,-24,-14,8,-13,14,2,0,-8,-17,-31,-18,23; MA /M: SY='C'; M=13,-18,34,-18,-20,-20,-14,-22,-13,-16,-13,-10,-15,-18,-16,-18,9,3,-9,-25,-20,-16; MA /M: SY='D'; M=-11,16,-31,23,4,-30,19,-12,-34,-12,-38,-28,9,-15,-7,-17,1,-13,-29,-31,-28,-1; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='Q'; M=1,-2,-23,-4,7,-28,-12,-5,-25,2,-20,-8,3,-5,22,1,3,-6,-17,-28,-16,12; MA /M: SY='S'; M=5,0,-18,0,6,-24,-9,-12,-22,10,-20,-13,1,-10,2,-3,16,3,-16,-30,-21,4; MA /M: SY='T'; M=15,-13,-7,-13,-9,-19,-11,-19,-8,-9,-10,-8,-8,-11,-9,-12,13,23,0,-26,-19,-9; MA /M: SY='L'; M=-7,-31,-10,-31,-24,-5,-34,-28,19,-19,22,14,-24,-24,-18,-21,-14,2,17,-23,-12,-23; MA /M: SY='D'; M=-13,27,-28,35,14,-29,-9,-6,-28,-5,-33,-22,14,-12,8,-11,3,-8,-26,-36,-24,10; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-40,20,50,-30,-20,0,-30,10,-30,-20,0,-10,20,0,0,-10,-20,-30,-20,40; MA /M: SY='F'; M=-15,-35,-15,-35,-30,30,-35,-20,10,-25,20,10,-30,-35,-25,-25,-20,-15,0,-5,10,-30; MA /M: SY='E'; M=-13,18,-35,30,35,-30,-17,-3,-30,3,-32,-20,3,-10,18,-5,0,-10,-23,-32,-22,28; MA /M: SY='R'; M=-11,-1,-34,-3,21,-28,-20,7,-30,13,-25,-15,1,-16,13,25,-6,-11,-26,-29,-17,17; MA /M: SY='L'; M=-6,-38,-9,-38,-28,-2,-37,-29,18,-19,36,18,-29,-28,-19,-19,-18,-9,9,-21,-11,-28; MA /M: SY='F'; M=10,-25,-10,-25,-20,20,-15,-15,-5,-20,-5,-5,-25,-25,-20,-20,-5,-10,-5,-10,5,-20; MA /M: SY='K'; M=-10,-5,-30,-15,5,-30,-20,-5,-30,35,-20,-10,0,-15,10,35,-5,-10,-25,-30,-20,5; MA /M: SY='Y'; M=-15,-30,-15,-30,-26,18,-35,-8,16,-26,6,1,-26,-31,-22,-26,-20,-15,10,-6,27,-26; MA /M: SY='N'; M=-10,20,-23,7,0,-27,0,3,-27,0,-27,-17,43,-17,0,-3,20,3,-27,-37,-20,0; MA /M: SY='D'; M=-18,35,-32,53,25,-30,-12,-8,-30,-7,-38,-28,8,-10,3,-17,0,-10,-28,-38,-28,15; MA /M: SY='D'; M=10,10,-15,20,5,-25,-5,-15,-20,-10,-25,-20,-5,-10,-5,-15,5,-5,-15,-35,-25,0; MA /M: SY='I'; M=-9,-30,-10,-30,-29,-1,-39,-30,39,-29,19,10,-30,-29,-29,-30,-20,-9,31,-30,-10,-29; MA /M: SY='I'; M=-10,-32,-10,-32,-30,0,-40,-30,37,-28,23,12,-30,-30,-28,-28,-20,-10,27,-28,-10,-30; MA /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-20,0,-30,-20,0,-30,20,-20,-10,0,-20,10,50,-10,-10,-30,-30,-20,0; MA /M: SY='H'; M=-20,8,-28,-5,-3,-12,-13,41,-27,-8,-27,-18,26,-22,-2,-3,-3,-12,-27,-22,12,-3; MA /M: SY='L'; M=-10,-34,-10,-34,-28,0,-38,-28,27,-23,28,21,-28,-28,-21,-23,-18,-10,18,-23,-10,-27; MA /M: SY='V'; M=-4,-28,-10,-28,-23,-7,-33,-29,31,-23,13,8,-28,-23,-23,-28,-18,0,33,-29,-11,-23; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-10,-30,-27,-3,-37,-30,37,-27,17,10,-30,-27,-27,-30,-20,-7,33,-30,-10,-27; MA /M: SY='R'; M=-9,-8,-28,-18,2,-28,-21,-6,-25,27,-18,-8,-3,-17,8,33,-8,-9,-21,-30,-19,2; MA /M: SY='E'; M=-10,1,-35,1,26,-30,-20,-1,-30,18,-25,-15,0,-14,15,23,-4,-10,-24,-30,-20,21; MA /M: SY='E'; M=-12,14,-38,24,42,-30,-18,-3,-30,10,-31,-21,2,-10,16,-2,0,-10,-22,-32,-22,33; MA /M: SY='H'; M=-10,2,-31,0,18,-21,-18,31,-28,3,-27,-17,3,-14,11,2,-3,-13,-23,-25,-2,16; MA /M: SY='A'; M=21,-4,-10,-1,-1,-23,-4,-17,-17,-3,-18,-14,-11,-10,-6,-9,7,-3,-9,-32,-22,-3; MA /M: SY='I'; M=-10,-18,-19,-19,-10,-11,-33,-21,14,-5,4,1,-19,-23,-14,-14,-13,-10,11,-30,-14,-11; MA /M: SY='T'; M=0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,10,50,0,-20,-20,-10; MA /M: SY='E'; M=-8,7,-38,15,38,-30,-7,-3,-32,5,-32,-22,0,-12,13,-3,0,-12,-22,-28,-22,30; MA /M: SY='E'; M=-2,5,-33,13,40,-28,-17,-3,-27,7,-27,-18,-3,-10,15,-2,2,-8,-17,-30,-20,32; MA /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,0,-20,-10,10,-10,0,-10,40,10,-20,-30,-20,0; MA /M: SY='L'; M=-7,-33,-10,-33,-25,-3,-33,-27,13,-17,30,15,-23,-27,-17,-18,-10,-7,5,-22,-12,-25; MA /M: SY='L'; M=-10,-38,-10,-38,-28,0,-38,-28,18,-18,37,25,-28,-28,-17,-18,-18,-10,10,-18,-10,-27; MA /M: SY='A'; M=32,-22,-2,-22,-12,-17,-5,-20,-7,-10,-5,0,-20,-12,-8,-10,7,-2,2,-27,-18,-10; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,-10,10,-30,-20,-10,-30,50,-20,-10,0,-10,10,20,0,-10,-20,-30,-20,10; MA /M: SY='S'; M=8,-2,-10,-2,-2,-20,-3,-12,-18,-2,-18,-10,8,-10,-2,-10,35,17,-17,-28,-20,-2; MA /M: SY='A'; M=33,-22,-2,-22,-12,-18,-5,-22,-3,-12,-7,-7,-22,-12,-12,-13,5,0,7,-30,-18,-12; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-40,20,50,-30,-20,0,-30,10,-30,-20,0,-10,20,0,0,-10,-20,-30,-20,40; MA /M: SY='E'; M=-10,7,-38,13,42,-30,-20,0,-30,12,-28,-18,0,-12,18,8,-2,-10,-22,-30,-20,33; MA /M: SY='K'; M=-10,2,-32,-5,17,-30,-20,-8,-30,43,-22,-12,0,-10,12,17,0,-10,-20,-30,-20,15; MA /M: SY='R'; M=-10,-7,-32,-13,8,-30,-20,0,-30,18,-22,-12,0,-18,12,42,-8,-10,-28,-30,-20,7; MA /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10; MA /M: SY='R'; M=-10,-10,-30,-20,0,-30,-20,0,-30,20,-20,-10,0,-20,10,50,-10,-10,-30,-30,-20,0; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,-10,10,-30,-20,-10,-30,50,-20,-10,0,-10,10,20,0,-10,-20,-30,-20,10; MA /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10; MA /M: SY='Q'; M=-7,0,-27,0,17,-28,-17,-2,-28,8,-20,-2,2,-10,42,7,7,-7,-20,-22,-12,25; MA /M: SY='R'; M=-10,-8,-30,-17,3,-30,-20,0,-30,18,-20,-8,0,-18,17,43,-8,-10,-28,-28,-18,5; MA /M: SY='E'; M=-2,5,-33,13,40,-28,-17,-3,-27,7,-27,-18,-3,-10,15,-2,2,-8,-17,-30,-20,32; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-40,20,50,-30,-20,0,-30,10,-30,-20,0,-10,20,0,0,-10,-20,-30,-20,40; MA /M: SY='A'; M=30,-22,-3,-22,-13,-7,-5,-18,-8,-13,-8,-8,-22,-15,-13,-13,5,-3,-2,-23,-12,-13; MA /M: SY='Q'; M=-2,-3,-25,-3,15,-28,-17,-3,-27,7,-18,-2,-3,-10,40,7,2,-8,-17,-22,-12,23; MA /M: SY='Q'; M=-2,-3,-25,-3,15,-28,-17,-3,-27,7,-18,-2,-3,-10,40,7,2,-8,-17,-22,-12,23; MA /M: SY='V'; M=5,-28,-8,-28,-20,-10,-27,-28,25,-20,8,7,-28,-20,-20,-27,-15,-2,32,-30,-12,-20; MA /M: SY='A'; M=22,-8,-10,-12,-3,-23,-3,-12,-17,-5,-15,-10,-3,-12,2,-5,8,-2,-8,-30,-18,-2; MA /M: SY='Q'; M=-12,8,-32,13,25,-30,-18,-2,-30,7,-25,-8,2,-10,37,3,0,-10,-22,-25,-15,28; MA /M: SY='E'; M=-7,5,-33,10,33,-28,-17,-2,-28,10,-27,-17,2,-12,15,7,5,-7,-22,-30,-20,27; MA /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-40,20,50,-30,-20,0,-30,10,-30,-20,0,-10,20,0,0,-10,-20,-30,-20,40; MA /M: SY='A'; M=40,-20,0,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-20,-10,-10,-10,10,0,0,-30,-20,-10; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; CC /GENERATED_BY="pfmake rs6_al.msf /usr/share/pftools23/blosum62.cmp"; //