Abinitio

Занятие 4

1. Азулен и нафталин

Молекула азулена, оптимизация с помощью UFF
Молекула нафталина, оптимизация не понадобилась

2. GAMESS

Конвертация в inp, с последующим внесением изменений было произведено. Полученные с помощью GAMESS файлы: azu_opt.log, nap_opt.log

3. Метод Хартри-Фока и теория функционала плотности для расчета энергии

Конвернтация Log-файлов с помощью babel была произведена (babel -igamout xxx_opt.log -ogamin xxx_hf/dft.inp). Изменения в заголовках с сохранением правильной пунктуации были внесены. C помощью GAMESS для новых входных файлов были посчитаны полные энергии для нафталина и азулена.

Вещество	E _Naptalene	E _Azulene	ΔE , Hartree	ΔE, kCal/mol
Хартри-Фок	-383.3549061523	-383.2824824441	0.0724237082	45,301177077502
DFT	-385.6401306541	-385.5857456095	0.0543850446	34,049677090230

Вывод: изменение энергии при изомеризации нафталина в азулен по методу Хатри-Фок составило - 45,301177077502, а с помощью теории функционала плотности - 34,049677090230. Ближе к экспериментальному значению последняя цифра, значит последний метод лучше.

©Джумашев