Семейство белковых доменов
- AC: PF00252
- Summary name: Ribosomal protein L16p/L10e
- Число последовательностей(seed): 406
- Число последовательностей(all): 72000
- Число доменных архитектур: 221
uL16 — консервативный белок большой рибосомальной субъединицы, присутствующий у всех клеточных организмов. Имеет α/β-домен (структура "молотка"). Изменения в структуре белка uL16 и соседних областях 23S рРНК способны приводить к развитию устойчивости к антибиотикам, так как данный белок непосредственно участвует в организации антибиотик-связывающего центра рибосомы.
N-концевой домен uL16 различается у бактерий, архей и эукариот, что отражает адаптацию к видовым особенностям рибосом. Большая часть белков принадлежат супер-царствам бактерий(27тыс) и эукариот(18тыс). Есть те, которые принадлежат археям(1,4тыс) и 21 вид, для которого не удалось определить принадлежность к супер-царству.
Карта локального сходства
- Доменная архитектура 1: PF00252
- Белок с архитектурой 1: P06383
- Доменная архитектура 2: PF00189 - PF00252
- Белок с архитектурой 2: B9TAP3
Значение E-value: 5е-26, что говорит о высокой достоверности. На карте локального сходства видно, что участок 20-55 первой последовательности и участок 545-580 второй последователньости совападают. Аналогично участки 55-132 и 575-665 тоже совпадают. На позиции 55(для первой) и 580(для второй) скорее всего находится индель.