Занятие 5.Выравнивание последовательностей
1)Выравнивание последовательностей с помощью программы GeneDoc:
Процент идентичности= 13/21*100=61,9%
Процент сходства=61,9%
alignment1.msf
2)Координаты последовательности seq1 в полной последовательности моего белка, определенная с помощью программы "bl2seq":
258-277
3)Выравнивание последовательностей белков ABNA_BACSU (организм:Bacillus subtilis) и YAGH_ECOLI (организм:Escherichia coli):
1 участок: 44-280/14-259
- процент идентичности ("Identities")=70/267 (27%)
- процент сходства ("Positives")= 104/267 (39%)
-число гэпов (Gaps)=51/267 (19%)
-координаты выровненных участков:
2 участок: 110-121/413-424
Identities = 7/12 (58%), Positives = 7/12 (58%), Gaps = 0/12 (0%)
Карта локального сходства:
© Акулич Ксения,2010