Занятие 6.Пакет EMBOSS. Программы парного выравнивания1)Расчет веса выравнивания вручную:
2)Веcа выравниваний совпадают, т.к. и я , и программа использовали одни и те же параметры (матрица BLOSUM62, штрафы 12 и 2) 3)а)частичное выравнивание:координаты 44-321/14-303 b)? совпадает c)Локальное выравнивание имеет больший вес (193.5>185). Вес глобального выравнивания не может быть больше веса локального, т.к. при локальном сравниваются более сходные между собой участки последовательностей, следовательно,будет меньше гэпов и штрафов за них, а именно от этого параметра зависит вес выравнивания.(чем больше вес, тем "точнее" выравнивание) |