Описание гипотетического белка из протеома Aeropyrum pernix штамм K1
Информация о белке и его гене, полученная из записи NP_000854.2 базы данных RefSeq с полным геномом бактерии, приведена в таблице 1. На рисунке 1 изображена окрестность в геноме гена описываемого белка.
Таблица 1. Информация о гипотетическом белке из генома Aeropyrum pernix штамм K1 (идентификатор NP_147299.2 в базе RefSeq)
| Вид информации | Квалификатор в записи генома | Значение |
| Локус гена в геноме | /locus_tag | APE_0525.1 |
| Имя гена | /gene | отсутствует |
| Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene | /db_xref=”GeneID:…” | 1444698 |
| Начало гена в геноме | — | 360842 |
| Конец гена в геноме | — | 361378 |
| Цепь, на которой кодируется ген | — | обратная |
| Длина гена (в парах нуклеотидов) | — | 537 |
| Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein | /protein_id | NP_147299.2 |
| Длина белка (в аминокислотных остатках) | — | 178 |
Рисунок 1. Геномная окрестность гена гипотетического белка из генома Aeropyrum pernix штамм K1. Ген отмечен черной рамкой. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)
На рисунке 1 видно, что исследуемый ген находится на обратной цепи и соседние гены имеют противоположную ориентацию относительно этого гена. Расстояние между исследуемым и соседним геном с 5'-конца — 19 нуклеотидов, с 3'-конца — 141 пара нуклеотидов. Скорее всего, эти гены не входят в оперон.
Структура белка рассмотрена на этой странице.