Задание 1. Краткий обзор Нобелевской премии 2013 года в области физиологии и медицины

Нобелевская премия 2013 года вручена исследователям Джеймсу Ротману, Рэнди Шекману и Томасу Зюдхофу за работу о механизме, осуществляющем везикулярный транспорт в клетке.

Начало исследования этого вопроса было положено двумя учеными: Шекманом, который стремился выяснить на клетках дрожжей устройство, регулирующее секреторный процесс, и Ротманом, который использовал в ходе опытов клетки млекопитающих. Было выяснено, что отвечающие за процесс sec гены с обоих видах клеток аналогичны. В конечном итоге, Шекман идентифицировал гены, отвечающие за транспорт везикул (вакуолей), перенос между ЭПР и аппаратом Гольджи. Ротман привнес в работу свои исследования о механизме слияния везикулярной мембраны с мембраной клетки, который осуществляется с помощью специальных SNARE белков. Зюдхоф же работал с нервными клетками. Нейромедиаторы (передатчики сигналов), находящиеся в везикулах, контактируют в оболочкой нейрона точно по такому же механизму, который описали Ротман и Шекман. Зюдхоф обнаружил, что кроме этой системы в данном процессе принимают участие ионы кальция, которые позволяют значительно ускорить слияние и изливание содержимого везикулы.

Таким образом, ученые выяснили механизм доставления содержимого везикулы в клетку и из нее, уделяя внимание аспекту скорости и слаженности процесса. На этой системе базируется множество физиологических процессов: от секреции ферментов до передачи сигналов в мозгу для последующего выделения гормонов. Эти открытия имеют решающее значение в медицине. Такие заболевания как ботулизм, столбняк, эпилепсия, шизофрения непосредственно связаны с нарушениями процесса слияния везикул. В итоге, открытия Ротмана, Зюдхофа и Шекмана обеспечивают лучшее понимание механизмов болезней и возможных способов лечения.

Задание 2. Запись MEDLINE с оригинальной статьёй, за которую выдана премия

Была взята одна из статей, упомянутыx в конце пресс-релиза (то есть в списке ключевых публикаций) на сайте Нобелевской премии[1].

поисковый запрос в PubMed: Kaiser CA[Author] AND Schekman R[Author] AND 1990[Date - Publication]

Информация о статье отражена в таблице 1.

Таблица 1. Данные о статье PMID 2188733

Род информации	Данные
Литературная ссылка	1: Kaiser CA, Schekman R. Distinct sets of SEC genes govern transport vesicle formation and fusion early in the secretory pathway. Cell. 1990 May 18;61(4):723-33. PubMed PMID: 2188733.
Гиперссылка в лит. ссылке на полную запись MEDLINE в виде текстового файла	PubMed PMID: 2188733
Количество публикаций, ссылающихся на статью ("Cited in ")	253
Количество статей по близкой тематике ("Related citation")	96
Сколько среди них обзоров ("Review")	7
Сколько среди них статей в открытом доступе ("Free")	67

Задание 3. Коллекция статей Р. Шекмана

запрос для поиска в PubMed публикаций этого автора в пределах двух с половиной лет от Нобелевской премии: Schekman R[Author] AND ("2011/06/10"[PDAT] : "2013/12/10"[PDAT])

ссылка на коллекцию: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/collections/public/1-iUVdgMfHQNNJ4zOQNcn4T5Z/

Найдено 14 статей, в написании которых принимал участие один из лауреатов 2013 года, Рэнди Шекман. Среди публикаций много исследований механизма работы COPII -- поверхностной системы, отвечающей за образование транспортных везикул из эндоплазматического ретикулума (ЭПР). Кроме того, есть работы, касающиеся ЭПР и комплекса Гольджи, выделения холестрина, работа о нетрадиционных способах секреции. Таким образом, последние два с половиной года Шекман занимался в целом той же тематикой, что и в Нобелевской статье.

Задание 4. Коллекция работ по данной теме не лауреатов Нобелевской премии

ссылка на коллекцию: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/myncbi/collections/public/1H5hp8c0-6hqU6aGzMHsGZbk1/

1. Поиск по ключевым словам (далее показаны запросы и количество найденных по ним статей соответственно)
   • (((((((vesicle[TIAB] AND ("Traffic"[Journal] OR "traffic"[TIAB])) AND (secretory[TIAB] AND ("proteins"[MeSH Terms] OR "proteins"[TIAB]))) OR ("golgi apparatus"[MeSH Terms] OR ("golgi"[TIAB] AND "apparatus"[TIAB]) OR "golgi apparatus"[TIAB] OR "golgi"[TIAB])) AND vesicle[TIAB]) OR vesicle fusion[TIAB]) NOT Schekman R[Author]) NOT Rothman JE[Author]) NOT Sudhof TC[Author] 4030
   • (((((((vesicle[TIAB] AND ("Traffic"[Journal] OR "traffic"[TIAB])) AND (secretory[TIAB] AND ("proteins"[MeSH Terms] OR "proteins"[TIAB]))) OR ("golgi apparatus"[MeSH Terms] OR ("golgi"[TIAB] AND "apparatus"[TIAB]) OR "golgi apparatus"[TIAB] OR "golgi"[TIAB])) AND vesicle[TIAB]) OR vesicle fusion[TIAB] AND SNARE [TIAB]) NOT Schekman R[Author]) NOT Rothman JE[Author]) NOT Sudhof TC[Author] 495
   • (((((((vesicle[TIAB] AND ("Traffic"[Journal] OR "traffic"[TIAB])) AND (secretory[TIAB] AND ("proteins"[MeSH Terms] OR "proteins"[TIAB]))) OR ("golgi apparatus"[MeSH Terms] OR ("golgi"[TIAB] AND "apparatus"[TIAB]) OR "golgi apparatus"[TIAB] OR "golgi"[TIAB])) AND vesicle[TIAB]) OR vesicle fusion[TIAB] AND COPII[TIAB]) NOT Schekman R[Author]) NOT Rothman JE[Author]) NOT Sudhof TC[Author] 146
   • (((((((vesicle[TIAB] AND ("Traffic"[Journal] OR "traffic"[TIAB])) AND (secretory[TIAB] AND ("proteins"[MeSH Terms] OR "proteins"[TIAB]))) OR ("golgi apparatus"[MeSH Terms] OR ("golgi"[TIAB] AND "apparatus"[TIAB]) OR "golgi apparatus"[TIAB] OR "golgi"[TIAB])) AND vesicle[TIAB]) OR vesicle fusion[TIAB] AND sec [TIAB]) NOT Schekman R[Author]) NOT Rothman JE[Author]) NOT Sudhof TC[Author] 28
2. Поиск в Related citations
   • по статье PMID 2188733: 96 находок
   • по статье PMID 8247129: 135 находок
3. Поиск в Cited in.. (работы, ссылающиеся на данную статью)
   • по статье PMID 2188733: 253 находки
   • по статье PMID 8247129: 136 находок

← Назад к второму семестру