Филогенетические деревья
Список бактерий
Enterococcus faecalis | ENTFA |
Geobacillus kaustophilus | GEOKA |
Lactobacillus acidophilus | LACAC |
Listeria monocytogenes | LISMO |
Staphylococcus aureus | STAA1 |
Staphylococcus epidermidis | STAES |
Bacillus anthracis | BACAN |
Скобочная формула дерева
((LACAC,ENTFA),((STAA1,STAES),(LISMO,(BACAN,GEOKA))));
Изображение дерева
Нетривиальные ветви дерева
- (LACAC,ENTFA) против (STAA1,STAES,LISMO,BACAN,GEOKA)
- (STAA1,STAES) против (LACAC,ENTFA,LISMO,BACAN,GEOKA)
- (BACAN,GEOKA,LISMO) против (LACAC,ENTFA,STAA1,STAES)
- (BACAN,GEOKA) против (LACAC,ENTFA,STAA1,STAES,LISMO)
Таксономия
"Верхние" таксономические единицы у всех бактерий таковы: cellular organisms; Bacteria; Firmicutes; Bacilli
"Нижние" отличаются:
- ENTFA Lactobacillales; Enterococcaceae; Enterococcus
- LACAC Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus
- STAA1 Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus
- STAES Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus
- LISMO Bacillales; Listeriaceae; Listeria
- BACAN Bacillales; Bacillaceae; Bacillus; Bacillus cereus group
- GEOKA Bacillales; Bacillaceae; Geobacillus
Таким образом, нетривиальная ветвь #1 выделяет Lactobacillales, ветвь #2 - Staphylococcaceae, ветвь #4 - Bacillaceae.