Структура молекулы, приведенной в документе 1ho5.pdb





Заголовок структуры (содержится в поле HEADER): ГИДРОЛАЗЫ.

Название структуры (содержится в поле TITLE): 5’-нуклеотидаза в комплексе с аденозином и фосфатом

Содержимое поля COMPND - полное название белка и количество полипептидных цепей,их 2(А и В)

Поля HET, HETNAM, FORMUL содержат иформацию о лигандах, ионах и молекулах воды.

- ADN (аденозин),

- PO4(фосфат-ион),

- MN (ион марганца II),

- HOH.

В документе представлены следущие цепи макромолекул:А и В

Идентификатор цепи Число остатков Название молекулы Комментарии
A 525 5'-NUCLEOTIDASE 5’-нуклеотидаза
В 525 5'-NUCLEOTIDASE 5’-нуклеотидаза


Cледующие низкомолекулярные вещества:ион марганца,фосфат-ион,аденозин и молекулы воды

ID Название Формула Число копий Комментарии
MN MANGANESE (II) ION MN 2+ 4 ион марганца
PO4 PHOSPHATE ION PO4 3- 2 фосфат-ион
ADN ADENOSINE C10 H13 N5 O4 2 аденозин
HOH Вода H2O 355 вода


Изображение цепи в остовной модели:

Малиновым цветом обозначены альфа - спирали,а желтым - бета-складки.



Характеристика вторичной структуры:

цепь белка имеет альфа-бета структуру. Количество альфа-спиралей: 45; бета-складок: 82; бета-поворотов: 109;водородных связей:720.





На рисунке остовные атомы серые, атомы кислорода показаны в виде красных шариков, а атомы азота - в виде синих шариков.