Краткое описание генома бактерии Ruminiclostridium thermocellum DSM 1313
Clostridium. Этот род насчитывает около 150 различных видов анаэробов, которые широко распространены практически во всех местах обитания, в которых бескислородные органические соединения присутствуют, в том числе в почве, в водных отложениях и в желудочно-кишечных трактах животных и человека. Характерной чертой clostridium является форма их клеток, которая напоминает голень или стержень ("clostridium" по-гречески означает "веретено"). Эта форма объясняется наличием эндоспор, которые развиваются в условиях, неблагоприятных для вегетативного роста и неизлечимо надувают одиночные клетки. Многие виды эндоспор крайне крепки и могут выжить и в кипящей воде, и под воздействием воздуха. Споры прорастают в условиях, благоприятных для вегетативного роста, таких как анаэробные при наличии органических субстратов. С точки зрения эволюции, clostridium считаются наиболее древними бактериями.
Бактерия Clostridium thermocellum. Её организм является термофильным и анаэробным. Бактерия производит внеклеточные ферментативные системы, способные разложить кристаллическую целлюлозу до растворимых сахаров, которые в дальнейшем используются в качестве источника углерода для роста. Ферментативная система состоит из ряда белков со специализированными функциями. Scaffoldins обеспечивают структурную основу и содержат целлюлозу, которую содержат бактерии, находящиеся на поверхности целлюлозного субстрата. В то же время, scaffoldins содержат область dockerin, с помощью которой целлюлозно-деградирующие ферменты прикрепляются к комплексу. Этот мульти-белковый комплекс называется cellulosome [1] .
Размер генома: 3.561.619 Количество генов в белке: 2917 Дата секвенирования генома 16:01:2006
[1] Информация о Ruminiclostridium thermocellum с сайта NCBI
Ссылки:
© Кузнецова Ксения, 2015