Практикум 8 Протеомы и Emboss
Протеом Escherichia coli MG1655. Идентификатор UP000000625. Число последовательностей - 4306. Число аминокислотных остатков - 1356086.
Протеом Ruminiclostridium thermocellum DSM 2360. Идентификатор UP0000004132. Число последовательностей - 3091. Число аминокислотных остатков - 983362.
| Остаток | Процент остатка в протеоме Escherichia coli MG1655 | Процент остатка в протеоме Ruminiclostridium thermocellum DSM 2360 | Разность процентов |
| L | 10,6726% | 6,2950% | 4,3776% |
| A | 9,5154% | 4,6582% | 4,8572% |
| G | 7,3746% | 4,9035% | 2,4712% |
| V | 7,0734% | 5,2495% | 1,8239% |
| I | 6,0103% | 6,1613% | -0,1510% |
| S | 5,8023% | 4,3985% | 1,4038% |
| E | 5,7628% | 5,4876% | 0,2752% |
| R | 5,5110% | 3,0818% | 2,4292% |
| T | 5,3991% | 3,6478% | 1,7513% |
| D | 5,1510% | 4,1486% | 1,0024% |
| Q | 4,4401% | 1,8291% | 2,6110% |
| P | 4,4254% | 2,4730% | 1,9524% |
| K | 4,4061% | 5,8060% | -1,4000% |
| N | 3,9454% | 3,8920% | 0,0534% |
| F | 3,8905% | 3,1096% | 0,7809% |
| Y | 2,8453% | 3,0370% | -0,1917% |
| M | 2,8193% | 1,8367% | 0,9826% |
| H | 2,2664% | 1,0184% | 1,2480% |
| W | 1,5312% | 0,6262% | 0,9050% |
| C | 1,1576% | 0,8550% | 0,3026% |
| U | 0,0002% | 0,0000% | 0,0002% |
Три самых часто встречающихся остатка в протеоме Escherichia coli MG1655 - Лейцин, Аланин, Глицин. А в протеоме Ruminiclostridium thermocellum DSM 2360 - Лейцин, Изолейцин, Лизин. Три самых редко встречающихся остатка в протеоме Escherichia coli MG1655 - Триптофан, Цистеин, Селеноцистеин. А в протеоме Ruminiclostridium thermocellum DSM 2360 селеноцистеин не встречается совсем, и наиболее редкие - Гистидин, Цистеин, Триптофан. Наибольшая по абсолютной величине разница 4,8572% в частотах в аланине.
Ссылки:
© Кузнецова Ксения, 2015