Белок принадлежит к бета-типу, все его вторичные
структуры являются бета-тяжами. Для рассмотрения строения и взаимодействия
вторичных структур выберем 2 антипараллельных бета-тяжа:

|
Рассмотрим 2 бета-тяжа отдельно от белковой цепи. Между
ними существуют водородные связи, поддерживающие стабильность цепи. На
рисунке изображены в шарнирной модели бета-тяжи(атомы азота синие, атомы
кислорода красные) и желтым цветом показаны водородные связи:
|
По изображенной структуре можно определить правило, по
которому образуется связь между антипараллельными бета-тяжами. Водородные
взаимодействия возникают при связывании N116 - O127 O116
- N127; N118 - O125 O118 - N125;
N120 - O123 O120 - N123, т.е. Nx
- Oy Ox - Ny; Nx+2 - Oy-2
Ox+2 - Ny-2. Также в одной из цепей возможно
возникновение водородных связей между атомами Ox - Nx+2.
|
|