Такосономическая классификация вируса согласно википедии:
Домен: Вирусы
Отряд: Nidovirales
Семейство: Astroviridae

Могут заражать человека, вызывая гатроэнтериты, симптомами которых являются тошнота, рвота и диарея. Госпитализации не требуется, т.к. симптомы через некоторое время проходят сами [1]

Согласно записи в базе данных EMBL (идентификатор – L23513), длина последовательности – 6771 пара нуклеотидов, в записи приведен весь геном вируса. В таблице 1 приведена информация о генах из генома вируса.

Таблица 1 –гены из генома Human Astrovirus type 1 strain Oxford

Номер Начало Конец Направление Длина
1 86 2848 прямое 2763
2 2776 4335 прямое 1573
3 4328 6691 прямое 2364

На рисунке 1 показана графическая интерпретация генома данного вируса.

Рисунок 1 - геном Human Astrovirus type 1 strain Oxford (идентификатор записи EMBL L23513). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI [2]

Гены перекрываются. Гены S и NS имеют рамку считывания +2.

Очень интересная деталь – между генами S и NS, судя по графику, генов нет, но кодирующая последовательность (CDS) прописана. Такой большой промежуток между генами в вирусном организме и прописанная там CDS – очень необычное явление, поэтому можно предположить, что ген там есть, но на графике он не отображен.

Далее, рассмотрим зону начала гена NS, ее графическое представление показано на рисунке 2.

Рисунок 2 - начало гена NS из генома вируса Human Astrovirus type 1 strain Oxford (идентификатор записи RefSeq L23513). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI [2]

Старт-кодон (ATG) стандартный, соответствует аминокислотному остатку метионина.

Источники:

[1] http://en.wikipedia.org/wiki/Astrovirus

[2] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/