$ load 3HZB.pdb METAL BINDING PROTEIN 23-JUN-09 3HZB CRYSTAL STRUCTURE OF A BETAGAMMA-CRYSTALLIN DOMAIN FROM FLAVOBACTERIUM JOHNSONIAE found biomolecule 1: A, B found biomolecule 2: C, D found biomolecule 3: E, F found biomolecule 4: G, H $ select Ca 20 атомов выбрано $ cpk 100 $ cpk 1000 целое число вне диапазона (-200 - 749) $ cpk 500 $ select all 6301 атомов выбрано $ cpk off $ backbones 10 script compiler ERROR: command expected ---- >>>> backbones 10 <<<< $ backbone 10 $ backbone 5 $ backbone 2 $ select ligand 20 атомов выбрано $ cpk 100 $ cpk 200 $ cpk 300 [HOH]219:H.O #6227 29.505 90.522 27.257 [HOH]119:H.O #6208 31.93 91.482 27.73 [HOH]94:H.O #6201 31.03 89.84 29.749 [HOH]120:H.O #6209 28.99 87.626 27.975 [LYS]78:H.O #5278 31.712 86.321 26.256 [GLN]53:H.CA #5089 31.658 84.819 29.887 [ASP]36:H.OD1 #4957 31.851 89.209 25.046 [ASP]36:H.OD1 #4957 31.851 89.209 25.046 [LYS]78:H.O #5278 31.712 86.321 26.256 [GLN]53:H.CA #5089 31.658 84.819 29.887 [ASP]36:H.OD1 #4957 31.851 89.209 25.046 [SER]80:H.OG #5296 34.037 88.953 27.658 [SER]80:H.OG #5296 34.037 88.953 27.658 [ASP]36:H.OD1 #4957 31.851 89.209 25.046 [LYS]78:H.O #5278 31.712 86.321 26.256 $ select (HOH) and (75-85:H) and (30-40:H) and (67-57:H) 0 атомов выбрано $ select (HOH) or (75-85:H) or (30-40:H) or (67-57:H) 1108 атомов выбрано $ select all 6301 атомов выбрано $ cpk off $ backbone off $ select all 6301 атомов выбрано $ backbone off $ wireframe off $ select (HOH) or (75-85:H) or (30-40:H) or (67-57:H) 1108 атомов выбрано $ cpk 200 $ wireframe 100 $ cpk 100 [HOH]231:G.O #6119 49.799 71.83 15.73 $ select all 6301 атомов выбрано $ cpk off $ wireframe off $ select within (5, Ca) 612 атомов выбрано $ cpk 100 [CA]116:H.CA #5370 31.487 88.531 27.452 $ select within (3.5, 116:H.CA) 0 атомов выбрано [CA]116:H.CA #5370 31.487 88.531 27.452 $ select within (3.5, 116:H) 10 атомов выбрано $ cpk 100 $ wireframe 50 $ select all 6301 атомов выбрано $ cpk off $ wireframe off $ select within (5, 116:H) 31 атомов выбрано $ cpk 100 $ wireframe 50 [GLN]53:H.OE1 #5095 28.399 84.857 28.356 [ASP]54:H.OD1 #5103 30.707 88.447 32.124 [ASN]35:H.CG #4948 34.814 91.296 25.268 [ASN]35:H.OD1 #4949 33.758 91.916 25.431 [ASN]35:H.ND2 #4950 35.18 90.293 26.044 $ select 53:H 9 атомов выбрано $ cpk off $ select 53:H 9 атомов выбрано $ cpk on $ cpk 100 [ASN]35:H.CG #4948 34.814 91.296 25.268 $ select 35:H.CG 1 атомов выбрано $ cpk off $ wireframe off [ASN]35:H.ND2 #4950 35.18 90.293 26.044 [ASN]35:H.OD1 #4949 33.758 91.916 25.431 $ select 35:H.ND2 1 атомов выбрано $ cpk off $ wireframe off $ select 35:H.OD1 1 атомов выбрано $ cpk off $ wireframe off $ select (35:H.OD1) or (35:H.ND2) or (35:H.CG) 3 атомов выбрано $ wireframe off [ASP]54:H.OD1 #5103 30.707 88.447 32.124 $ select 54:H.OD1 1 атомов выбрано $ cpk off [GLN]53:H.N #5088 32.53 83.768 30.384 $ select 53:H.N 1 атомов выбрано $ cpk off [GLN]53:H.NE2 #5096 28.847 82.696 27.946 $ select 53:H.NE2 1 атомов выбрано $ cpk off [GLN]53:H.OE1 #5095 28.399 84.857 28.356 $ select 53:H.OE1 1 атомов выбрано $ cpk off [GLN]53:H.CB #5092 30.288 84.753 30.567 [GLN]53:H.CG #5093 29.405 83.596 30.128 [GLN]53:H.CD #5094 28.844 83.772 28.726 $ select 53:H.C* 0 атомов выбрано $ select 53:H.C? 5 атомов выбрано $ select 53:H.CB 1 атомов выбрано $ cpk off $ select 53:H.CG 1 атомов выбрано $ cpk off $ select 53:H.CD 1 атомов выбрано $ cpk off $