На выбор было предложено несколько белков. Случайным образом мною был выбран белок Q04719 В Uniprot можно его название Early 53 kDa protein. Результаты работы с данной последовательностью представлены в таблице 1.
Номер итерации Число находок выше порога (0,005) Идентификатор худшей находки выше порога E-value этой находки Идентификатор лучшей находки ниже порога E-value этой находки
1 64 ME53 [Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus] 1e-05/TD> me53 [Spodoptera litura granulovirus] 0.013
2 86 ORF909 homolog [Xestia c-nigrum granulovirus] 9e-04 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain [Penicillium roqueforti FM164] 0.20
3 86 ORF909 homolog [Xestia c-nigrum granulovirus] 1e-30 hypothetical protein ZHAS_00021930 [Anopheles sinensis] 0.38
4 86 ORF909 homolog [Xestia c-nigrum granulovirus] 3e-34 histidyl-tRNA synthetase [Clostridium sp. DL-VIII] 0.20
Скачать последовательности, с которыми была проведена работа можно по этой ссылке. Файл в формате fasta можно скачать здесь по этой ссылке

Для данных белков было построено выравнивание. Проект в формате JVP можно скачать по этой ссылке. Фрагмент выравнивания показан на рисунке 2.

BLOSUM62
Рис. 2 Фрагмент выравнивания полученных гомологов