Скрипт на Python | Учебный сайт Валяевой Анны

Скрипт на языке программирования Python

Скрипт, о котором я расскажу, был выполнен на одном из практикумов по биоинформатике и действительно имеет отношение к биоинформатике. Если вы хотите испытать его собственноручно, здесь вы можете его скачать.

Итак, целью написания этого скрипта была не только практика программирования (хотя, конечно, в основном именно она), но и практическое использование. Например, у Вас есть текстовый файл с разнообразнейшими белковыми последовательностями в fasta-формате. Но они все такие разные, и их ужасно неудобно анализировать. Что делать, скажите Вы?.. Не паникуйте, у Вас есть уникальная возможность, воспользоваться написанным мной скриптом!

Скрипт принимает 2 аргумента из командной строки: имя файла (в fasta-формате) и число (целое) -- количество букв в строке при распечатке последовательностей в fasta-формате. Далее задается класс "Protein", его инициализирующий метод и метод, позволяющий напечатать на экран обработанную информацию. Затем идет непосредственно алгоритм обработки файла.

В итоге, на экран выводятся белковые последовательности с заданным количеством букв в строке.