Изучение файла структурных факторов

Получаемые в результате РСА эксперимента структурные факторы записываются в текстовый файл формата mmCIF, который можно скачать с сайта PDB. Так выглядит файл со структурными факторами для белка с PDB ID 4GP7 - полинуклеотид киназы организма Ruminiclostridium thermocellum. На основе данного файла была составлена таблица, которая содержит значения средних измерений структурных факторов и стандартных отклонений для измереннных троек (h,k,l) и силу каждого сигнала (F/sigma).

92,5% (23356) структурных факторов из этого файла можно назвать "хорошими" - их сила сигнала больше 3, то есть их значение в 3 раза или больше превосходит средне квадратичное нескольких измерений. Для некоторых троек (h,k,l), например, для (0,0,5), (5,12,22), (15,11,10), (16,18,20) и (19,14,8), структурные факторы не измерены.

Информацию о том, какие структурные факторы были использованы для оптимизации модели или для ее оценки (подсчета свободного R-фактора), можно получить из колонки _refln.status, где буква "о" означает то, что соответствующий структурный фактор был использован для оптимизации модели, а "f" - для подсчета R-free. Также буква "x" означает то, что измерение данного структурного фактора ненадежно, поэтому не использовалось ни дла оптимизации модели, ни для ее оценки. Всего в рассматриваемом файле содержится информация о 25245 структурных факторах, из них 23021 имеют статус "o", 1977 - "f" и 247 - "x".