Практикум 11
В этом практикуме были изучены гомология и выравнивание.
Для выполнения задания был выбран домен Nfu_N AC:PF12906 (Scaffold protein Nfu/NifU N terminal).
Файл Jalview: PF12906
| Таблица 11-3 | Информация | Комментарии |
|---|---|---|
| Выравнивание seed | Число последовательностей: 21 Число колонок: 68 |
|
| МДБ-all | Номер колонок: 36-43 | |
| 100% консервативные колонки в МДБ-all | 36:H 39:C 43:W |
|
| МДБ-notAll | Номер колонок: 22-43 Последовательности: 1-16 |
|
| 100% консервативные колонки в МДБ-notAll | 22:[LWFI] 26:C 28:C 30:G 35:[VMFAI] |
Частично консервативные: 25:P (15 из 16) 31:[ST] (14 из 16) 32:[IVLM] (14 из 16) 26:[ILFV] (12 из16) |
| Участок выравнивания, не отражающий ход эволюции. | 47-64 | В выравнивании много гэпов, нет консервтивных участков |