Практикум 1. Филогенетическое дерево.

Задание 1

Таблица 1. Отобранные бактерии.

Скобочная формула дерева

((((BRUSU, BARHE), (RHIME, AGRFC)), ACICJ), ((YERPE, SERP5), ECOLI));

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит пять нетривиальных ветвей:

1) {SERP5, YERPE} против {ECOLI, ACICJ, AGRFC, RHIME, BARHE, BRUSU}

2) {SERP5, YERPE, ECOLI} против {ACICJ, AGRFC, RHIME, BARHE, BRUSU}

3) {AGRFC, RHIME} против {SERP5, YERPE, ECOLI, ACICJ, BARHE, BRUSU}

4) {BARHE, BRUSU} против {SERP5, YERPE, ECOLI, ACICJ, AGRFC, RHIME}

5) {BARHE, BRUSU, AGRFC, RHIME} против {SERP5, YERPE, ECOLI, ACICJ}

Таксоны, соответствующие нетривиальным ветвям

{SERP5, YERPE} - семейство Yersiniaceae

{SERP5, YERPE, ECOLI} - порядок Enterobacterales

{AGRFC, RHIME} - семейство Rhizobiaceae

{BARHE, BRUSU, AGRFC, RHIME} - порядок Hyphomicrobiales