В качестве примера был рассмотрен домен с ID:B3GALT2_N AC:PF19341 (Description: Beta-1,3-galactosyltransferase 2 N-terminus), число последовательностей: seed: 20, full: 305. Результат исследования выравнивания с помощью программы Jalview представлен в файле.
Паттерн найденного блока: [PHL][YF].[YW].[IL]NEP.KC, позиция в последовательности: с 93 по 104 аминокислотный остаток. Поиск по последовательности показал, что данная последовательность не повторяется в других участках белков, также о гомологии свидетельствует сохранение во всех белках выравнивания аминокислотных остатков аспарагина, глутаминовой кислоты, пролина, лизина и цистеина на 99, 100, 101, 103 и 104 позициях соответственно.
Паттерн найденного частичного блока: EN[TS][LM]S[AT]N, положение в последовательности: с 65 по 71 аминокислотный остаток. Общие участки можно выделить у белков W5NMI7_LEPOC, A0A1S3P9B5_SALSA, F6V488_ORNAN, Q640C6_XENLA, A0A0Q3TDI8_AMAAE, A0A0P7ZAE2_SCLFO, A0A099Z2H9_TINGU. Поиск упомянутого домена по всем последовательностям не был других результатов, помимо данного участка.
Положение минус-блока в последовательности: с 39 по 50 аминокислотный остаток. Состоит практически полностью из гэпов, из имеющихся на данном участке аминокислотных остатков совпадают не более двух подряд и не более чем в двух последовательностях из рассматриваемых 20.