Overlap area in Angstrom^2 between polygons defined by atoms on successive
bases. Polygons projected in the mean plane of the designed base-pair step.

Values in parentheses measure the overlap of base ring atoms only. Those
outside parentheses include exocyclic atoms on the ring. Intra- and
inter-strand overlap is designated according to the following diagram:

                    i2  3'      5' j2
                       /|\      |
                        |       |
               Strand I |       | II
                        |       |
                        |       |
                        |      \|/
                    i1  5'      3' j1

     step      i1-i2        i1-j2        j1-i2        j1-j2        sum
   1 GG/CC  3.66( 2.18)  0.00( 0.00)  0.39( 0.00)  1.01( 0.21)  5.06( 2.38)
   2 GG/CC  3.51( 2.12)  0.00( 0.00)  0.80( 0.00)  0.00( 0.00)  4.31( 2.12)
   3 GG/CC  4.30( 2.56)  0.00( 0.00)  0.83( 0.00)  0.00( 0.00)  5.13( 2.56)
   4 GU/AC  6.59( 3.65)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.43( 2.87) 11.02( 6.52)
   5 UA/UA  0.56( 0.00)  0.00( 0.00)  2.46( 1.75)  0.00( 0.00)  3.02( 1.75)
   6 AC/GU  2.36( 0.94)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  7.15( 4.52)  9.51( 5.46)
   7 CG/CG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.78( 2.91)  0.00( 0.00)  5.78( 2.91)
   8 GA/UC  4.36( 3.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.24( 0.00)  4.60( 3.00)
   9 AG/CU  4.26( 3.40)  0.00( 0.00)  0.45( 0.00)  0.00( 0.00)  4.71( 3.40)
  10 GG/CC  3.05( 1.56)  0.00( 0.00)  1.34( 0.00)  0.00( 0.00)  4.40( 1.56)
  11 GU/AC  7.23( 4.23)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.31( 2.58) 12.53( 6.81)
  12 UU/GA  4.75( 2.36)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.39( 3.28) 10.14( 5.65)
  13 UA/UG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)
  14 AU/UU  4.13( 0.55)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  1.61( 0.50)  5.74( 1.04)
  15 UU/AU  2.04( 0.73)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.94( 4.50)  7.98( 5.23)
  16 UC/GA  0.35( 0.08)  0.00( 0.00)  0.33( 0.00)  2.29( 0.88)  2.98( 0.96)
  17 CC/GG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  1.39( 0.02)  1.82( 0.45)  3.21( 0.47)
  18 CG/CG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.44( 2.67)  0.00( 0.00)  5.44( 2.67)
  19 GG/CC  2.61( 1.11)  0.00( 0.00)  1.17( 0.00)  0.00( 0.00)  3.77( 1.11)
  20 GA/AC  3.60( 1.16)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.40( 1.70)  7.01( 2.86)
  21 AG/CA  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  1.56( 0.39)  0.00( 0.00)  1.56( 0.39)
  22 GC/GC  4.95( 2.09)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  6.86( 3.65) 11.81( 5.74)
  23 CC/GG  0.56( 0.16)  0.00( 0.00)  0.13( 0.00)  1.75( 0.45)  2.44( 0.62)
  24 CA/GG  4.52( 2.04)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.52( 2.04)
  25 AA/AG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  6.56( 4.29)  6.56( 4.29)
  26 AG/UA  4.33( 3.52)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.42( 3.38)  8.75( 6.90)
  27 GG/CU  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)