Контакты

Работа с программой Rasmol Исследованы контакты белка бета-галактозидаза с лигандом аллолактоза.

цепь белка	первый контактирующий остаток	лиганд	контактирующие атомы	расстояние в ангстремах	тип связи
A	HIS540	LAK2001	NE2,O6	2,76	водородная
A	ASN102	LAK2001	ND2,O5	3,24	водородная
A	NA3101(ион натрия)	LAK2001	NA,O6	2,26	координационная
A	GLN537	LAK2001	NE2,O3	4,16	водородная

Мой лиганд окружён атомами, которые не связаны с ним гидрофобными взаимодействиями
Гидрофобных-43 атома, не гидрофобных-123 атома. (Оценено для радиуса 4 ангстрема)
ASP201, TYR999, MET502, TYR503, GLU464, ASN604-примеры аминокислотных остатков,
связанных гидрофобными взаимодействиями с лигандом.
Лиганд аллолактоза в окружении радиусом 3 ангстрема НА ГЛАВНУЮ