Топология,нарисованная по правилам TOPS cartoons
Работа с программами Word и RasMol
Изображена топология фрагмента аминокислотной последовательности с 299 по 641 остатки цепи А.
В моём белке 4 цепи: А, B, C, D. Структурный класс
домена, с которым я работаю- (альфа+бета)-домен,
классы остальных доменов те же. В участке 299-641А
8 альфа-спиралей, 12 бета-тяжей, часть из которых
формирует нечто похожее на бета-баррель.
У N- и C- концов находится по "шпильке".
Рассмотрим структуру бета-листа, находящегося в центре домена (условного), который включает в себя аминокислотные остатки с 299 по 641 цепи А. В него входят
аминокислотные остатки с 351 по 412. В этом листе все тяжи параллельные. Альфа-спирали между тяжами игнорируем.
Бета-тяжи в этом листе расположены в порядке 1.2.3., считая с N-конца.
На этой схеме изображен бета-лист(цилиндрами обозначены
альфа-спирали, через которые соединяются бета-тяжи).

НА ГЛАВНУЮ