Поиск мотивов в последовательности белка бета-галактозидаза

Работа с базой данных мотивов и доменов Prosite
В базе данных PROSITE собрана коллекция сайтов, мотивов и доменов. Они описаны с помощью паттернов и правил.
С помощью программы ScanProsite (Scan a protein for PROSITE matches) были найдено 10 известных мотивов в последовательности белка бета-галактозидаза.

Идентификатор паттерна
(accession number)		 Идентификатор документации PROSITE
и краткое описание или
название паттерна в соответствии с
этим документом		Паттерн (регулярное выражение )
или правила		Число мотивов,
обнаруженных в
моем белке
PS00001* PDOC00001 сайт N-гликозилированияN-{P}-[ST]-{P}5
PS00003* PDOC00003 Сайт тирозинового сульфинирования
  1. Glu or Asp между двумя остатками Tyr
    (как правило на -1 позиции).
  2. Как минимум три кислотных остатка в области от -5 до +5.
  3. Не более 1 основного и 3 гидрофобных от -5 до +5
  4. Как минимум один Pro или Gly от -7 до -2 и от +1 до +7 или как минимум 2 или 3 Asp, Ser or Asn от -7 до +7.
  5. Отсутствие связанного дисульфидными связями Cys от -7 до +7
  6. Отсутствие азот-связанных глюканов около тирозина.
1
PS00005* PDOC00005 Cайт фосфорилирования киназы[ST]-x-[RK]9
PS00006 * PDOC00006 Сайт 2 фосфорилирования казеиновой киcлоты[ST]-x(2)-[DE]12
PS00007 * PDOC00007 Сайт фосфорилирования тирозинa[RK]-x(2,3)-[DE]-x(2,3)-Y1
PS00008 * PDOC00008 Сайт N-миристилизацииG-{EDRKHPFYW}-x(2)-[STAGCN]-{P}12
PS00016 * PDOC00016 последовательность, контактирующая с клеткой R-G-D1
PS00017 * PDOC00017ATФ/ГTФ-сайт связывания (P- петля)[AG]-x(4)-G-K-[ST]1
PS00719 PDOC00531Подпись 1 второго гликозид-гидролазного семействаN-x-[LIVMFYWD]-R-[STACN](2)-H-Y-P-x(4)-[LIVMFYWS](2)-x(3)-[DN]-x(2)- G-[LIVMFYW](4)1
PS00608 PDOC00531 кислотно-основный катализатор из семейства гликозид-гликолазного семейства 2[DENQLF]-[KRVW]-N-[HRY]-[STAPV]-[SAC]-[LIVMFS](3)-W-[GS]-x(2,3)-N-E1

* -часто встречающиеся в белках мотивы

[DENQLF]-[KRVW]-N-[HRY]-[STAPV]-[SAC]-[LIVMFS](3)-W-[GS]-x(2,3)-N-E - это паттерн мотива PDOC00531 (кислотно-основный катализатор из семейства гликозил-гликолазного семейства 2)
Пример аминокислотной последовательности, идеально удовлетворяющей условиям данного паттерна, но не такой, как в последовательности
белка бета-галактозидаза:
L-W-N-Y-A-C-V-M-S-W-S-G-Q-N-E
НА ГЛАВНУЮ